128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2311 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_2311  Flp pilus assembly protein CpaB  100 
 
 		 258 aa  516  1e-146  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0750  Flp pilus assembly protein CpaB  31.42 
 
 		 298 aa  125  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0646  SAF domain-containing protein  29.59 
 
 		 298 aa  119  7e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.361703 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2692  Flp pilus assembly protein CpaB  35.66 
 
 		 286 aa  116  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000594167  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0706  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  27.92 
 
 		 298 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0245  SAF domain-containing protein  35.15 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2919  putative Flp pilus assembly CpaB  26.25 
 
 		 363 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6874  Flp pilus assembly protein CpaB  27.75 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.367067  normal  0.327856 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  29.36 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  26.81 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  26.42 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  28.5 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  28.5 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  28.5 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  29.28 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2020  SAF domain-containing protein  27.92 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  26.09 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4344  Flp pilus assembly protein CpaB  26.57 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.684033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  27.02 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  27.02 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  27.73 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  27.02 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  27 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1746  Flp pilus assembly protein CpaB  26.8 
 
 		 272 aa  67  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2702  Flp pilus assembly protein CpaB  27.46 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2479  Flp pilus assembly protein CpaB  27.78 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.801269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  24.69 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  25.33 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4869  SAF domain-containing protein  27.07 
 
 		 332 aa  65.5  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  26.99 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2407  Flp pilus assembly protein CpaB  30.57 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  24.9 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  25.54 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  25.44 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1080  Flp pilus assembly CpaB  27.13 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  29.29 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.658434 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3486  Flp pilus assembly protein CpaB  25.26 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0314928 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2012  SAF domain-containing protein  27.48 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  26.15 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2826  Flp pilus assembly protein CpaB  29.47 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  24.19 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  25.35 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2058  Flp pilus assembly CpaB  27.54 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308551  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  25.53 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  25.2 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0792  Flp pilus assembly CpaB  23.58 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0325336  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1130  Flp pilus assembly CpaB  27.03 
 
 		 345 aa  57  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0287562  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  26.86 
 
 		 281 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2385  Flp pilus assembly protein CpaB  28.95 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  26.86 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2039  CpaB family Flp pilus assembly protein  25.68 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.621232  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1872  putative pilus assembly protein CpaB  25.68 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1884  putative pilus assembly protein CpaB  25.68 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222645  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1681  Flp pilus assembly protein CpaB  25.68 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0337  Flp pilus assembly CpaB  25.68 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.720767  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0824  Flp pilus assembly protein CpaB  25.68 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.570609  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  24.21 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  24.05 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2460  CpaB family Flp pilus assembly protein  26.61 
 
 		 345 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0968707  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  24.44 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  25.62 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  25.97 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3203  Flp pilus assembly protein CpaB  23.81 
 
 		 291 aa  53.1  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200873 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0232  SAF domain-containing protein  26.78 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1058  Flp pilus assembly protein CpaB  23.81 
 
 		 291 aa  52.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1733  Flp pilus assembly protein CpaB  26.75 
 
 		 313 aa  52.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619975  hitchhiker  0.0000143429 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1518  Flp pilus assembly protein CpaB  24.38 
 
 		 280 aa  52.4  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1854  Flp pilus assembly protein CpaB  25.23 
 
 		 245 aa  52.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0981653  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3420  Flp pilus assembly CpaB  27.54 
 
 		 342 aa  52.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  26.13 
 
 		 292 aa  52  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0302  Flp pilus assembly CpaB  24.78 
 
 		 275 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3927  Flp pilus assembly protein CpaB  27.54 
 
 		 342 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152772  normal  0.4164 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1652  Flp pilus assembly protein CpaB  23.77 
 
 		 316 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0069  SAF domain-containing protein  24.65 
 
 		 317 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723058 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  27.18 
 
 		 307 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55930  putative pilus assembly protein  28.1 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0418  Flp pilus assembly CpaB  22.99 
 
 		 278 aa  50.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1442  Flp pilus assembly protein CpaB  24.89 
 
 		 311 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257298 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  25.77 
 
 		 307 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0218  component of type IV pilus  26.09 
 
 		 269 aa  49.3  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1728  Flp pilus assembly CpaB  22.62 
 
 		 296 aa  49.3  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  24.08 
 
 		 291 aa  49.3  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2543  CpaB family Flp pilus assembly protein  28.65 
 
 		 292 aa  48.9  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4187  Flp pilus assembly protein CpaB  27.03 
 
 		 271 aa  48.5  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1291  hypothetical protein  28.09 
 
 		 299 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1940  CpaB family Flp pilus assembly protein  28.09 
 
 		 348 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0235089  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2041  Flp pilus assembly protein CpaB  24.62 
 
 		 308 aa  48.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.106466  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0392  Flp pilus assembly CpaB  25 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.373428  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1779  hypothetical protein  28.09 
 
 		 299 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0116  hypothetical protein  28.09 
 
 		 299 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1788  putative pilus assembly protein CpaB  28.09 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1049  putative pilus assembly protein CpaB  28.09 
 
 		 299 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.342434  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0722  SAF domain-containing protein  26.92 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268977  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2799  putative signal peptide protein, CpaB like  23.43 
 
 		 316 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1767  putative pilus assembly protein CpaB  28.09 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.726426  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3351  SAF domain-containing protein  24.36 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4357  Flp pilus assembly protein CpaB  23.71 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4247  Flp pilus assembly protein CpaB  23.71 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.262876 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2318  Flp pilus assembly protein CpaB  26.28 
 
 		 233 aa  47  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  24.31 
 
 		 322 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>