111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2919 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2919  putative Flp pilus assembly CpaB  100 
 
 		 363 aa  732    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6874  Flp pilus assembly protein CpaB  78.2 
 
 		 366 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.367067  normal  0.327856 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4344  Flp pilus assembly protein CpaB  45.38 
 
 		 339 aa  230  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.684033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0750  Flp pilus assembly protein CpaB  31.29 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0646  SAF domain-containing protein  29.74 
 
 		 298 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.361703 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0706  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  29.1 
 
 		 298 aa  96.3  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2311  Flp pilus assembly protein CpaB  26.25 
 
 		 258 aa  94.4  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2692  Flp pilus assembly protein CpaB  26.46 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000594167  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0245  SAF domain-containing protein  26.05 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2073  Flp pilus assembly protein CpaB  34.76 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10677  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4390  Flp pilus assembly CpaB  26.55 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.752776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1733  Flp pilus assembly protein CpaB  27.57 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619975  hitchhiker  0.0000143429 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4850  hypothetical protein  27.32 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2460  CpaB family Flp pilus assembly protein  28.88 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0968707  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2385  Flp pilus assembly protein CpaB  27.85 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1080  Flp pilus assembly CpaB  25.1 
 
 		 342 aa  59.3  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2826  Flp pilus assembly protein CpaB  27.27 
 
 		 267 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1884  putative pilus assembly protein CpaB  31.33 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2039  CpaB family Flp pilus assembly protein  31.33 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.621232  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1681  Flp pilus assembly protein CpaB  31.33 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0337  Flp pilus assembly CpaB  31.33 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.720767  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1872  putative pilus assembly protein CpaB  31.33 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0824  Flp pilus assembly protein CpaB  31.33 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.570609  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  24.8 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1652  Flp pilus assembly protein CpaB  35.34 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55930  putative pilus assembly protein  30.37 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4357  Flp pilus assembly protein CpaB  30.72 
 
 		 307 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0849  Flp pilus assembly protein CpaB  27.57 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4247  Flp pilus assembly protein CpaB  30.72 
 
 		 307 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.262876 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0649  Flp pilus assembly CpaB  30.37 
 
 		 312 aa  57  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2058  Flp pilus assembly CpaB  28.1 
 
 		 342 aa  57  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308551  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1442  Flp pilus assembly protein CpaB  24.44 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257298 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2020  SAF domain-containing protein  29.41 
 
 		 275 aa  55.8  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0302  Flp pilus assembly CpaB  24.8 
 
 		 275 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  30.3 
 
 		 261 aa  55.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3420  Flp pilus assembly CpaB  27.69 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5408  Flp pilus assembly CpaB  28.8 
 
 		 318 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4660  Flp pilus assembly CpaB  22.99 
 
 		 300 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000880779  hitchhiker  0.0033273 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  29.85 
 
 		 279 aa  54.7  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1518  Flp pilus assembly protein CpaB  31.82 
 
 		 280 aa  54.3  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3927  Flp pilus assembly protein CpaB  27.69 
 
 		 342 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152772  normal  0.4164 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2543  CpaB family Flp pilus assembly protein  28.5 
 
 		 292 aa  53.9  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  27.71 
 
 		 233 aa  52.8  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  29.1 
 
 		 281 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2799  putative signal peptide protein, CpaB like  35.94 
 
 		 316 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  29.55 
 
 		 279 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  29.55 
 
 		 279 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  23.95 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  29.1 
 
 		 281 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  29.1 
 
 		 281 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3203  Flp pilus assembly protein CpaB  24.57 
 
 		 291 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200873 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  29.55 
 
 		 279 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2163  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  30.82 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143104 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  29.55 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4872  Flp pilus assembly protein CpaB  30.15 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  29.55 
 
 		 279 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  29.55 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1058  Flp pilus assembly protein CpaB  24.14 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  29.77 
 
 		 280 aa  51.2  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1040  Flp pilus assembly CpaB  27.92 
 
 		 301 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000512138  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1520  Flp pilus assembly CpaB  27.92 
 
 		 301 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000592722  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1496  Flp pilus assembly protein CpaB  27.92 
 
 		 301 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000496809  hitchhiker  0.000000663837 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2690  Flp pilus assembly protein CpaB  23.24 
 
 		 338 aa  51.2  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1728  Flp pilus assembly CpaB  22.66 
 
 		 296 aa  50.8  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  32.18 
 
 		 274 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2345  Flp pilus assembly CpaB  28.35 
 
 		 287 aa  49.7  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1130  Flp pilus assembly CpaB  25.37 
 
 		 345 aa  49.3  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0287562  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  30.43 
 
 		 272 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1940  CpaB family Flp pilus assembly protein  29.63 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0235089  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  28.24 
 
 		 281 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  27.75 
 
 		 292 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1767  putative pilus assembly protein CpaB  29.63 
 
 		 299 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.726426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1788  putative pilus assembly protein CpaB  29.63 
 
 		 299 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0305  SAF domain-containing protein  30.82 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  22.54 
 
 		 289 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3486  Flp pilus assembly protein CpaB  27.31 
 
 		 292 aa  48.5  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0314928 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0392  Flp pilus assembly CpaB  22.86 
 
 		 260 aa  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.373428  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3653  pilus assembly protein  29.37 
 
 		 319 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.588333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  25.42 
 
 		 283 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1291  hypothetical protein  28.89 
 
 		 299 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  27.4 
 
 		 262 aa  47.4  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  26.64 
 
 		 284 aa  47.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1779  hypothetical protein  28.89 
 
 		 299 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0116  hypothetical protein  28.89 
 
 		 299 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1049  putative pilus assembly protein CpaB  28.89 
 
 		 299 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.342434  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  26.04 
 
 		 269 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  30.11 
 
 		 272 aa  46.2  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2566  Flp pilus assembly protein CpaB  24.43 
 
 		 307 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1910  putative Flp pilus assembly protein CpaB  23.17 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0558  putative Flp pilus assembly protein CpaB  23.58 
 
 		 274 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0069  SAF domain-containing protein  27.07 
 
 		 317 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723058 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  24.06 
 
 		 274 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2479  Flp pilus assembly protein CpaB  28.3 
 
 		 261 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.801269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  27.14 
 
 		 282 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  27.4 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  27.97 
 
 		 288 aa  44.3  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0309  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  23.63 
 
 		 274 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0218  component of type IV pilus  25.71 
 
 		 269 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1643  Flp pilus assembly CpaB  25.65 
 
 		 299 aa  43.9  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000168863  normal  0.463494 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  27.16 
 
 		 283 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>