101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4850 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4850  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  712    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4390  Flp pilus assembly CpaB  83.39 
 
 
319 aa  525  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.752776  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0649  Flp pilus assembly CpaB  49.69 
 
 
312 aa  263  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0849  Flp pilus assembly protein CpaB  52.12 
 
 
315 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55930  putative pilus assembly protein  38.52 
 
 
303 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319663  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4872  Flp pilus assembly protein CpaB  36.31 
 
 
303 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1643  Flp pilus assembly CpaB  29.3 
 
 
299 aa  98.2  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000168863  normal  0.463494 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2163  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  29.86 
 
 
316 aa  98.2  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.143104 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4247  Flp pilus assembly protein CpaB  33.87 
 
 
307 aa  90.1  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.262876 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4444  Flp pilus assembly protein CpaB  29.92 
 
 
331 aa  90.1  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4357  Flp pilus assembly protein CpaB  33.87 
 
 
307 aa  90.1  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5408  Flp pilus assembly CpaB  33.18 
 
 
318 aa  89.7  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1733  Flp pilus assembly protein CpaB  30.43 
 
 
313 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619975  hitchhiker  0.0000143429 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1442  Flp pilus assembly protein CpaB  30.35 
 
 
311 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.257298 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1652  Flp pilus assembly protein CpaB  28.74 
 
 
316 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4660  Flp pilus assembly CpaB  28.73 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000880779  hitchhiker  0.0033273 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3653  pilus assembly protein  31.72 
 
 
319 aa  76.6  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.588333  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1657  Flp pilus assembly CpaB  32.58 
 
 
342 aa  75.5  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.255393  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2799  putative signal peptide protein, CpaB like  30.59 
 
 
316 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1040  Flp pilus assembly CpaB  28.73 
 
 
301 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000512138  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1520  Flp pilus assembly CpaB  28.73 
 
 
301 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000592722  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1496  Flp pilus assembly protein CpaB  28.73 
 
 
301 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000496809  hitchhiker  0.000000663837 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1402  CpaB family Flp pilus assembly protein  28.41 
 
 
301 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168447  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2543  CpaB family Flp pilus assembly protein  28.57 
 
 
292 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2320  Flp pilus assembly protein CpaB  29.75 
 
 
345 aa  70.5  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_003296  RS02596  signal peptide protein  35.77 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.818766 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2073  Flp pilus assembly protein CpaB  31.07 
 
 
363 aa  66.6  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10677  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1767  putative pilus assembly protein CpaB  30.81 
 
 
299 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.726426  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1940  CpaB family Flp pilus assembly protein  30.3 
 
 
348 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0235089  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1788  putative pilus assembly protein CpaB  30.3 
 
 
299 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1291  hypothetical protein  29.8 
 
 
299 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1779  hypothetical protein  29.8 
 
 
299 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0116  hypothetical protein  29.8 
 
 
299 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1049  putative pilus assembly protein CpaB  29.8 
 
 
299 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.342434  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2919  putative Flp pilus assembly CpaB  27.32 
 
 
363 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1058  Flp pilus assembly protein CpaB  26.67 
 
 
291 aa  60.1  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  30.95 
 
 
272 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3203  Flp pilus assembly protein CpaB  29.93 
 
 
291 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200873 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  27.4 
 
 
291 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  31.12 
 
 
233 aa  57.8  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  30.3 
 
 
322 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  31.3 
 
 
289 aa  57  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  29.35 
 
 
307 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2039  CpaB family Flp pilus assembly protein  33.33 
 
 
350 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.621232  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1746  Flp pilus assembly protein CpaB  25.37 
 
 
272 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  29.85 
 
 
307 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  30.83 
 
 
272 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1681  Flp pilus assembly protein CpaB  33.33 
 
 
350 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0337  Flp pilus assembly CpaB  33.33 
 
 
350 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.720767  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1872  putative pilus assembly protein CpaB  33.33 
 
 
350 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0824  Flp pilus assembly protein CpaB  33.33 
 
 
350 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.570609  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  27.27 
 
 
234 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0069  SAF domain-containing protein  29 
 
 
317 aa  55.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.723058 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2460  CpaB family Flp pilus assembly protein  33.33 
 
 
345 aa  54.3  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0968707  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1884  putative pilus assembly protein CpaB  33.33 
 
 
350 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222645  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  28.57 
 
 
280 aa  54.3  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2058  Flp pilus assembly CpaB  31.19 
 
 
342 aa  52.8  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308551  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  29.69 
 
 
279 aa  53.1  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  24.43 
 
 
292 aa  52.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2012  SAF domain-containing protein  24.66 
 
 
272 aa  51.6  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  29.17 
 
 
281 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  29.17 
 
 
281 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  29.17 
 
 
281 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  27.14 
 
 
269 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2020  SAF domain-containing protein  31.06 
 
 
275 aa  50.4  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  26.42 
 
 
274 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1728  Flp pilus assembly CpaB  25.11 
 
 
296 aa  50.4  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  28.74 
 
 
281 aa  50.1  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4344  Flp pilus assembly protein CpaB  26.53 
 
 
339 aa  50.1  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.684033  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2491  Flp pilus assembly protein CpaB  29.47 
 
 
247 aa  50.1  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144514 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6874  Flp pilus assembly protein CpaB  26.87 
 
 
366 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.367067  normal  0.327856 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3420  Flp pilus assembly CpaB  33.08 
 
 
342 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1515  Flp pilus assembly CpaB  27.5 
 
 
260 aa  47.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.670297  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3927  Flp pilus assembly protein CpaB  33.08 
 
 
342 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152772  normal  0.4164 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  25 
 
 
251 aa  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1513  hypothetical protein  32.26 
 
 
309 aa  47  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.139808 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  27.4 
 
 
282 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7030  putative pilus assembly protein, cpaB  27.81 
 
 
249 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  0.799048 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3486  Flp pilus assembly protein CpaB  23.26 
 
 
292 aa  46.2  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0314928 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  28.14 
 
 
266 aa  45.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  27.31 
 
 
261 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5682  putative pilus assembly protein cpaB  27.7 
 
 
266 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  29.23 
 
 
274 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2318  Flp pilus assembly protein CpaB  28.24 
 
 
233 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  27.57 
 
 
283 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1021  Flp pilus assembly protein CpaB  30.99 
 
 
258 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  28.83 
 
 
279 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0392  Flp pilus assembly CpaB  28.51 
 
 
260 aa  44.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.373428  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  28.83 
 
 
279 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  28.83 
 
 
279 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0646  SAF domain-containing protein  25.9 
 
 
298 aa  44.3  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.361703 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  28.83 
 
 
279 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4404  Flp pilus assembly protein CpaB  29.14 
 
 
305 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  28.83 
 
 
281 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  28.83 
 
 
281 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2690  Flp pilus assembly protein CpaB  31.01 
 
 
338 aa  43.5  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  26.01 
 
 
288 aa  43.1  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0302  Flp pilus assembly CpaB  29.28 
 
 
275 aa  43.1  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1785  Flp pilus assembly CpaB  25.75 
 
 
265 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.634606  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  31.53 
 
 
283 aa  42.7  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>