138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3486 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3486  Flp pilus assembly protein CpaB  100 
 
 		 292 aa  562  1.0000000000000001e-159  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0314928 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2020  SAF domain-containing protein  41.18 
 
 		 275 aa  160  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2058  Flp pilus assembly CpaB  38.21 
 
 		 342 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308551  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3420  Flp pilus assembly CpaB  36.96 
 
 		 342 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3927  Flp pilus assembly protein CpaB  36.96 
 
 		 342 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152772  normal  0.4164 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4869  SAF domain-containing protein  35.08 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2690  Flp pilus assembly protein CpaB  35.21 
 
 		 338 aa  104  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1513  hypothetical protein  34.47 
 
 		 309 aa  102  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139808 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1080  Flp pilus assembly CpaB  32.79 
 
 		 342 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2460  CpaB family Flp pilus assembly protein  34.74 
 
 		 345 aa  97.8  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0968707  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1681  Flp pilus assembly protein CpaB  35.06 
 
 		 350 aa  95.9  8e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0337  Flp pilus assembly CpaB  35.06 
 
 		 350 aa  95.9  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.720767  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0824  Flp pilus assembly protein CpaB  35.06 
 
 		 350 aa  95.9  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.570609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2039  CpaB family Flp pilus assembly protein  35.06 
 
 		 350 aa  95.5  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.621232  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1872  putative pilus assembly protein CpaB  35.06 
 
 		 350 aa  95.5  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1884  putative pilus assembly protein CpaB  33.56 
 
 		 350 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222645  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0418  Flp pilus assembly CpaB  33.48 
 
 		 278 aa  94  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3519  Flp pilus assembly CpaB  33.18 
 
 		 266 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1130  Flp pilus assembly CpaB  32.68 
 
 		 345 aa  89.7  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0287562  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0392  Flp pilus assembly CpaB  30.12 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.373428  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3712  Flp pilus assembly CpaB  31.46 
 
 		 265 aa  85.5  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.241083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0302  Flp pilus assembly CpaB  30.53 
 
 		 275 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2826  Flp pilus assembly protein CpaB  31.88 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1785  Flp pilus assembly CpaB  30.37 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.634606  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7030  putative pilus assembly protein, cpaB  32.62 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  0.799048 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  31.15 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2385  Flp pilus assembly protein CpaB  31.6 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5682  putative pilus assembly protein cpaB  31.5 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4194  Flp pilus assembly protein CpaB  27.54 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0218  component of type IV pilus  31.25 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  34.66 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2407  Flp pilus assembly protein CpaB  30.98 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0894  Flp pilus assembly protein CpaB  36.61 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4187  Flp pilus assembly protein CpaB  32.11 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0232  SAF domain-containing protein  27.87 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  29.75 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  33.85 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2041  Flp pilus assembly protein CpaB  32.77 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.106466  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3351  SAF domain-containing protein  27.53 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0305  SAF domain-containing protein  30.56 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  29.05 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  32.71 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.658434 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0722  SAF domain-containing protein  33.17 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268977  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4615  Flp pilus assembly protein CpaB  30.64 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2702  Flp pilus assembly protein CpaB  29.95 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2479  Flp pilus assembly protein CpaB  29.82 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.801269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  31.43 
 
 		 322 aa  72.4  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  32.98 
 
 		 281 aa  72  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  31.91 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4475  Flp pilus assembly protein CpaB  31.82 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  29.76 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0666  Flp pilus assembly protein CpaB  32.79 
 
 		 314 aa  68.9  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.406757  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  32.28 
 
 		 281 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  33.16 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  27.73 
 
 		 272 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  32.28 
 
 		 281 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  32.28 
 
 		 281 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0609  putative CpaB2 pilus assembly protein  30.65 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.620793  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  30.33 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2012  SAF domain-containing protein  26 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  29.92 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  29.92 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2318  Flp pilus assembly protein CpaB  32.12 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1515  Flp pilus assembly CpaB  29.19 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.670297  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  30.8 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  29.51 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3996  pilus assembly protein cpaB  32.52 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  26.25 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4660  Flp pilus assembly CpaB  29.32 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000880779  hitchhiker  0.0033273 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2345  Flp pilus assembly CpaB  26.27 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  30.33 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2311  Flp pilus assembly protein CpaB  25.26 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  29.1 
 
 		 281 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1652  Flp pilus assembly protein CpaB  30.12 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  26.45 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  30.41 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0792  Flp pilus assembly CpaB  32.8 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0325336  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1040  Flp pilus assembly CpaB  28.57 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000512138  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1520  Flp pilus assembly CpaB  28.57 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000592722  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0245  SAF domain-containing protein  25.69 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1496  Flp pilus assembly protein CpaB  28.57 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000496809  hitchhiker  0.000000663837 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5126  SAF domain-containing protein  30.09 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0670857 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1518  Flp pilus assembly protein CpaB  31.22 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  30.24 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  29.76 
 
 		 307 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4404  Flp pilus assembly protein CpaB  25.79 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  28.93 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  28.43 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2566  Flp pilus assembly protein CpaB  28.22 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  26.25 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  30.4 
 
 		 262 aa  55.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  31.16 
 
 		 266 aa  55.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2543  CpaB family Flp pilus assembly protein  30.35 
 
 		 292 aa  55.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1940  CpaB family Flp pilus assembly protein  31.13 
 
 		 348 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0235089  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2799  putative signal peptide protein, CpaB like  30.52 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0750  Flp pilus assembly protein CpaB  22.84 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  27.18 
 
 		 233 aa  53.9  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4444  Flp pilus assembly protein CpaB  27.75 
 
 		 331 aa  53.5  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1788  putative pilus assembly protein CpaB  31.13 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  30.13 
 
 		 263 aa  53.1  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>