111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2073 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2073  Flp pilus assembly protein CpaB  100 
 
 		 363 aa  706    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10677  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4444  Flp pilus assembly protein CpaB  42.42 
 
 		 331 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2799  putative signal peptide protein, CpaB like  38.74 
 
 		 316 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1652  Flp pilus assembly protein CpaB  38.27 
 
 		 316 aa  152  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5408  Flp pilus assembly CpaB  37.09 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1402  CpaB family Flp pilus assembly protein  37.22 
 
 		 301 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168447  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1442  Flp pilus assembly protein CpaB  36.13 
 
 		 311 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257298 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1940  CpaB family Flp pilus assembly protein  38.85 
 
 		 348 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0235089  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1788  putative pilus assembly protein CpaB  38.85 
 
 		 299 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1291  hypothetical protein  38.46 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1779  hypothetical protein  38.46 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0116  hypothetical protein  38.46 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1049  putative pilus assembly protein CpaB  38.46 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.342434  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1767  putative pilus assembly protein CpaB  38.46 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.726426  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1733  Flp pilus assembly protein CpaB  34.75 
 
 		 313 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619975  hitchhiker  0.0000143429 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4660  Flp pilus assembly CpaB  37.22 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000880779  hitchhiker  0.0033273 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3653  pilus assembly protein  37.11 
 
 		 319 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.588333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1040  Flp pilus assembly CpaB  36.39 
 
 		 301 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000512138  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1520  Flp pilus assembly CpaB  36.39 
 
 		 301 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000592722  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1496  Flp pilus assembly protein CpaB  36.39 
 
 		 301 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000496809  hitchhiker  0.000000663837 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2320  Flp pilus assembly protein CpaB  35.43 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2543  CpaB family Flp pilus assembly protein  36.4 
 
 		 292 aa  124  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2327  Flp pilus assembly protein CpaB  37.62 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.296928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2705  hypothetical protein  37.62 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.787376  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4357  Flp pilus assembly protein CpaB  34.73 
 
 		 307 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4247  Flp pilus assembly protein CpaB  34.73 
 
 		 307 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.262876 
 
 
-
 
NC_003296  RS02596  signal peptide protein  40.14 
 
 		 208 aa  86.3  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818766 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0649  Flp pilus assembly CpaB  33.48 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1643  Flp pilus assembly CpaB  30.3 
 
 		 299 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000168863  normal  0.463494 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4390  Flp pilus assembly CpaB  28.19 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.752776  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4850  hypothetical protein  31.07 
 
 		 357 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0069  SAF domain-containing protein  31 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723058 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55930  putative pilus assembly protein  32.55 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1657  Flp pilus assembly CpaB  30.74 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.255393  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2163  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  30.99 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143104 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  29.44 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4872  Flp pilus assembly protein CpaB  31.08 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0849  Flp pilus assembly protein CpaB  30.39 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2407  Flp pilus assembly protein CpaB  29.34 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1746  Flp pilus assembly protein CpaB  28.38 
 
 		 272 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  29.65 
 
 		 272 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  28.57 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2919  putative Flp pilus assembly CpaB  34.76 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  29.48 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  25.84 
 
 		 288 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  34.75 
 
 		 233 aa  62  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2479  Flp pilus assembly protein CpaB  29.46 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.801269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  29.19 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  26.54 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4404  Flp pilus assembly protein CpaB  26.46 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  28.84 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0706  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  23.75 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0998  Flp pilus assembly CpaB  27.36 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.82555 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  24.52 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  27.4 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  25.74 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2702  Flp pilus assembly protein CpaB  29.07 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  29.19 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  24.76 
 
 		 279 aa  57  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2041  Flp pilus assembly protein CpaB  30.22 
 
 		 308 aa  57  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.106466  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  23.77 
 
 		 280 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  26.27 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  25.76 
 
 		 281 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0792  Flp pilus assembly CpaB  27.31 
 
 		 286 aa  55.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0325336  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  25.36 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  26.26 
 
 		 281 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  25.36 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  25.36 
 
 		 279 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  24.04 
 
 		 281 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  24.04 
 
 		 281 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  24.04 
 
 		 281 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  25.25 
 
 		 279 aa  53.9  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0750  Flp pilus assembly protein CpaB  24.63 
 
 		 298 aa  54.3  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6874  Flp pilus assembly protein CpaB  31.52 
 
 		 366 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.367067  normal  0.327856 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  22.99 
 
 		 283 aa  53.9  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  25.4 
 
 		 295 aa  53.1  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  24 
 
 		 281 aa  52.8  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  23.18 
 
 		 291 aa  52.8  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  27.13 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  25 
 
 		 283 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  25.19 
 
 		 289 aa  50.4  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1518  Flp pilus assembly protein CpaB  23.36 
 
 		 280 aa  50.1  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1274  SAF domain protein  34.19 
 
 		 237 aa  48.1  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0833437  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3515  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  31.94 
 
 		 293 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3996  pilus assembly protein cpaB  25.94 
 
 		 270 aa  47.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0646  SAF domain-containing protein  23.31 
 
 		 298 aa  47.4  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.361703 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0722  SAF domain-containing protein  27.17 
 
 		 271 aa  47.4  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268977  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0232  SAF domain-containing protein  29.17 
 
 		 250 aa  47.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4194  Flp pilus assembly protein CpaB  25.43 
 
 		 296 aa  47  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2385  Flp pilus assembly protein CpaB  29.73 
 
 		 268 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2058  Flp pilus assembly CpaB  29.71 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308551  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1515  Flp pilus assembly CpaB  31.13 
 
 		 260 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.670297  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1728  Flp pilus assembly CpaB  24.63 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2460  CpaB family Flp pilus assembly protein  28.17 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0968707  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0392  Flp pilus assembly CpaB  26.35 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.373428  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3420  Flp pilus assembly CpaB  25.81 
 
 		 342 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3927  Flp pilus assembly protein CpaB  25.81 
 
 		 342 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152772  normal  0.4164 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4615  Flp pilus assembly protein CpaB  28.33 
 
 		 270 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1058  Flp pilus assembly protein CpaB  25.23 
 
 		 291 aa  44.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2566  Flp pilus assembly protein CpaB  25.48 
 
 		 307 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>