150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1518 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1518  Flp pilus assembly protein CpaB  100 
 
 		 280 aa  558  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  54.7 
 
 		 284 aa  296  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  53.08 
 
 		 282 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  52.3 
 
 		 279 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  58.85 
 
 		 288 aa  281  9e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  55.47 
 
 		 269 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  50 
 
 		 279 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  54.01 
 
 		 283 aa  275  4e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  50 
 
 		 279 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  52.3 
 
 		 279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  53.08 
 
 		 283 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0792  Flp pilus assembly CpaB  53.38 
 
 		 286 aa  271  9e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0325336  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  50 
 
 		 281 aa  269  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  49.66 
 
 		 281 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  53.02 
 
 		 280 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  53.02 
 
 		 279 aa  258  8e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  59.83 
 
 		 281 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  59.83 
 
 		 281 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  59.83 
 
 		 281 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  51.49 
 
 		 261 aa  252  5.000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  54.61 
 
 		 281 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  45.54 
 
 		 262 aa  191  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  45.41 
 
 		 266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  43.03 
 
 		 263 aa  181  8.000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  45.05 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1746  Flp pilus assembly protein CpaB  37.89 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1058  Flp pilus assembly protein CpaB  41.15 
 
 		 291 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3203  Flp pilus assembly protein CpaB  40.87 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200873 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  37.08 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  36.61 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  37.4 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  38.31 
 
 		 307 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  37.3 
 
 		 274 aa  132  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  38.81 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  35.8 
 
 		 295 aa  129  6e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2012  SAF domain-containing protein  35.37 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  38.4 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  40.09 
 
 		 272 aa  123  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  37.67 
 
 		 272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2566  Flp pilus assembly protein CpaB  37.38 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4404  Flp pilus assembly protein CpaB  36.14 
 
 		 305 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3006  Flp pilus assembly protein CpaB  42.36 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  39.27 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1515  Flp pilus assembly CpaB  31.28 
 
 		 260 aa  95.9  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.670297  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1080  Flp pilus assembly CpaB  30.84 
 
 		 342 aa  92.8  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2385  Flp pilus assembly protein CpaB  33.47 
 
 		 268 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7030  putative pilus assembly protein, cpaB  33.16 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  0.799048 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3519  Flp pilus assembly CpaB  32.38 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2345  Flp pilus assembly CpaB  26.73 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1130  Flp pilus assembly CpaB  28.1 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0287562  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2826  Flp pilus assembly protein CpaB  33.33 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4869  SAF domain-containing protein  31.41 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0392  Flp pilus assembly CpaB  34.92 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.373428  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0218  component of type IV pilus  31.41 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0609  putative CpaB2 pilus assembly protein  32.91 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.620793  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0302  Flp pilus assembly CpaB  32.98 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2479  Flp pilus assembly protein CpaB  32.35 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.801269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4194  Flp pilus assembly protein CpaB  30.28 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1785  Flp pilus assembly CpaB  31.09 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.634606  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2702  Flp pilus assembly protein CpaB  31.76 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5126  SAF domain-containing protein  31.93 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0670857 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2407  Flp pilus assembly protein CpaB  30.8 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0418  Flp pilus assembly CpaB  27.89 
 
 		 278 aa  75.5  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5682  putative pilus assembly protein cpaB  32.64 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1130  SAF domain protein  26.24 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0998  Flp pilus assembly CpaB  25.4 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.82555 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0309  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  31.71 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4187  Flp pilus assembly protein CpaB  29.79 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4615  Flp pilus assembly protein CpaB  32.14 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1910  putative Flp pilus assembly protein CpaB  30.08 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0558  putative Flp pilus assembly protein CpaB  30.08 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3712  Flp pilus assembly CpaB  31.75 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.241083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0750  Flp pilus assembly protein CpaB  24.91 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2058  Flp pilus assembly CpaB  31.38 
 
 		 342 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308551  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  31.25 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  31.44 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.658434 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  28.64 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1652  Flp pilus assembly protein CpaB  30.57 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2543  CpaB family Flp pilus assembly protein  28.94 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4475  Flp pilus assembly protein CpaB  30.32 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4872  Flp pilus assembly protein CpaB  31.85 
 
 		 303 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0646  SAF domain-containing protein  28.26 
 
 		 298 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.361703 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1402  CpaB family Flp pilus assembly protein  31.63 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168447  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3927  Flp pilus assembly protein CpaB  29.2 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152772  normal  0.4164 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2318  Flp pilus assembly protein CpaB  27.95 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3996  pilus assembly protein cpaB  28.43 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3420  Flp pilus assembly CpaB  29.2 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2799  putative signal peptide protein, CpaB like  30.41 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3351  SAF domain-containing protein  28.19 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0722  SAF domain-containing protein  30 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268977  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  30.6 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0069  SAF domain-containing protein  29.55 
 
 		 317 aa  62  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723058 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5408  Flp pilus assembly CpaB  28.5 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2020  SAF domain-containing protein  33.9 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1733  Flp pilus assembly protein CpaB  28.36 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619975  hitchhiker  0.0000143429 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1940  CpaB family Flp pilus assembly protein  28.65 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0235089  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2460  CpaB family Flp pilus assembly protein  35.25 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0968707  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1767  putative pilus assembly protein CpaB  30.21 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.726426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1788  putative pilus assembly protein CpaB  28.65 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1884  putative pilus assembly protein CpaB  32.9 
 
 		 350 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>