159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0799 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  100 
 
 		 263 aa  526  1e-148  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  72.87 
 
 		 262 aa  364  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  69.11 
 
 		 266 aa  332  4e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  44.96 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  45.02 
 
 		 284 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0792  Flp pilus assembly CpaB  48.62 
 
 		 286 aa  199  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0325336  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  44.64 
 
 		 288 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  47.03 
 
 		 269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  48.08 
 
 		 280 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  46.88 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  41.39 
 
 		 279 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  44.24 
 
 		 279 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  44.24 
 
 		 279 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  44.24 
 
 		 279 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  47.03 
 
 		 279 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  46.6 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  46.04 
 
 		 281 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  46.04 
 
 		 281 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  46.04 
 
 		 281 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  44.29 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  44.7 
 
 		 281 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  44.7 
 
 		 281 aa  175  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1518  Flp pilus assembly protein CpaB  43.23 
 
 		 280 aa  172  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  48.04 
 
 		 281 aa  171  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1746  Flp pilus assembly protein CpaB  39.62 
 
 		 272 aa  145  6e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1058  Flp pilus assembly protein CpaB  34.23 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3203  Flp pilus assembly protein CpaB  35.02 
 
 		 291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200873 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4404  Flp pilus assembly protein CpaB  38.33 
 
 		 305 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  35.27 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  35.16 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  31.16 
 
 		 292 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  34.39 
 
 		 251 aa  109  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  32.19 
 
 		 295 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  34.76 
 
 		 274 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2566  Flp pilus assembly protein CpaB  38.24 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  32.58 
 
 		 322 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2012  SAF domain-containing protein  32.34 
 
 		 272 aa  105  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  30.37 
 
 		 274 aa  102  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  34.05 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2479  Flp pilus assembly protein CpaB  34.47 
 
 		 261 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.801269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  32.37 
 
 		 307 aa  99  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2702  Flp pilus assembly protein CpaB  34.04 
 
 		 261 aa  99  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  31.88 
 
 		 307 aa  98.6  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  32.73 
 
 		 272 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0302  Flp pilus assembly CpaB  34.32 
 
 		 275 aa  97.4  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0392  Flp pilus assembly CpaB  34.07 
 
 		 260 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.373428  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3006  Flp pilus assembly protein CpaB  35.16 
 
 		 309 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1515  Flp pilus assembly CpaB  35.68 
 
 		 260 aa  95.9  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.670297  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  28.7 
 
 		 234 aa  95.5  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2407  Flp pilus assembly protein CpaB  33.76 
 
 		 260 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5682  putative pilus assembly protein cpaB  34.78 
 
 		 266 aa  92.8  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7030  putative pilus assembly protein, cpaB  34.04 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  0.799048 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3712  Flp pilus assembly CpaB  32.89 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.241083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1785  Flp pilus assembly CpaB  32.5 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.634606  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2826  Flp pilus assembly protein CpaB  31.63 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0646  SAF domain-containing protein  28.51 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.361703 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1130  SAF domain protein  32.97 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0750  Flp pilus assembly protein CpaB  28.32 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2385  Flp pilus assembly protein CpaB  32.64 
 
 		 268 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3519  Flp pilus assembly CpaB  31.84 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  32.23 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  30.99 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.658434 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0218  component of type IV pilus  29.32 
 
 		 269 aa  78.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0706  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  27.31 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4615  Flp pilus assembly protein CpaB  32.8 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4869  SAF domain-containing protein  29.26 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1080  Flp pilus assembly CpaB  26.18 
 
 		 342 aa  75.9  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0722  SAF domain-containing protein  30.52 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268977  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1130  Flp pilus assembly CpaB  30.58 
 
 		 345 aa  75.5  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0287562  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5126  SAF domain-containing protein  30.4 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0670857 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3351  SAF domain-containing protein  29.26 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4194  Flp pilus assembly protein CpaB  34.62 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4187  Flp pilus assembly protein CpaB  33.71 
 
 		 271 aa  72  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0998  Flp pilus assembly CpaB  28.11 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.82555 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2345  Flp pilus assembly CpaB  24.89 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0609  putative CpaB2 pilus assembly protein  29.69 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.620793  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3996  pilus assembly protein cpaB  30.41 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2311  Flp pilus assembly protein CpaB  27.73 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1910  putative Flp pilus assembly protein CpaB  25.83 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0558  putative Flp pilus assembly protein CpaB  25.83 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0232  SAF domain-containing protein  29.03 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0418  Flp pilus assembly CpaB  27.51 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1652  Flp pilus assembly protein CpaB  29.69 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1728  Flp pilus assembly CpaB  27.76 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5408  Flp pilus assembly CpaB  30.29 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0309  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  29.9 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4475  Flp pilus assembly protein CpaB  32.77 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2460  CpaB family Flp pilus assembly protein  32.41 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0968707  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4247  Flp pilus assembly protein CpaB  34.04 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.262876 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2020  SAF domain-containing protein  28.89 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4357  Flp pilus assembly protein CpaB  34.04 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  31.44 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3653  pilus assembly protein  30.73 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.588333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3114  SAF domain-containing protein  31.38 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1817  Flp pilus assembly protein CpaB  33.77 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.745683  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02596  signal peptide protein  36.09 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818766 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2039  CpaB family Flp pilus assembly protein  31.58 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.621232  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1402  CpaB family Flp pilus assembly protein  30.89 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168447  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1681  Flp pilus assembly protein CpaB  31.58 
 
 		 350 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0337  Flp pilus assembly CpaB  31.58 
 
 		 350 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.720767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>