75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3114 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3114  SAF domain-containing protein  100 
 
 		 244 aa  474  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1854  Flp pilus assembly protein CpaB  35.84 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0981653  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2931  hypothetical protein  33.33 
 
 		 259 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.59237  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3424  SAF domain protein  33.73 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.34975  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2646  SAF domain protein  33.64 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2923  hypothetical protein  28.15 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00621975  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  31.91 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2637  hypothetical protein  25.77 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  29.33 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20640  Flp pilus assembly protein CpaB  30.61 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  27.94 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  31.73 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  30.26 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  30.82 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  30.09 
 
 		 307 aa  55.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  29.07 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  26.38 
 
 		 295 aa  54.7  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  29.07 
 
 		 279 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1515  Flp pilus assembly CpaB  31.41 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.670297  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4442  hypothetical protein  27.71 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0197871 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  29.65 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  29.65 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  29.65 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  32.05 
 
 		 292 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  29.3 
 
 		 233 aa  53.1  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  34.21 
 
 		 251 aa  52.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0795  Flp pilus assembly protein CpaB  27.33 
 
 		 390 aa  52.4  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  27.53 
 
 		 279 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  27.53 
 
 		 279 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3006  Flp pilus assembly protein CpaB  31.58 
 
 		 309 aa  52  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  27.13 
 
 		 279 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  29.2 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  27.92 
 
 		 322 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  28.75 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0792  Flp pilus assembly CpaB  29.45 
 
 		 286 aa  49.7  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0325336  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  28.4 
 
 		 281 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  28.4 
 
 		 281 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1733  Flp pilus assembly protein CpaB  31.9 
 
 		 313 aa  49.3  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619975  hitchhiker  0.0000143429 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  29.14 
 
 		 261 aa  49.3  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2311  Flp pilus assembly protein CpaB  25.48 
 
 		 258 aa  49.3  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4404  Flp pilus assembly protein CpaB  29.13 
 
 		 305 aa  48.9  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  28.98 
 
 		 283 aa  48.9  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0116  hypothetical protein  35.29 
 
 		 299 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1049  putative pilus assembly protein CpaB  35.29 
 
 		 299 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.342434  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1779  hypothetical protein  35.29 
 
 		 299 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1291  hypothetical protein  35.29 
 
 		 299 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0535  Flp pilus assembly protein CpaB  31.38 
 
 		 215 aa  48.9  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  25 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  25.81 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0646  SAF domain-containing protein  27.05 
 
 		 298 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.361703 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1442  Flp pilus assembly protein CpaB  29.91 
 
 		 311 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257298 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  29.87 
 
 		 280 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2543  CpaB family Flp pilus assembly protein  35 
 
 		 292 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  29.17 
 
 		 281 aa  46.6  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1728  Flp pilus assembly CpaB  24.52 
 
 		 296 aa  46.6  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1940  CpaB family Flp pilus assembly protein  34.45 
 
 		 348 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0235089  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1788  putative pilus assembly protein CpaB  34.45 
 
 		 299 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1767  putative pilus assembly protein CpaB  34.45 
 
 		 299 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.726426  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1652  Flp pilus assembly protein CpaB  28.06 
 
 		 316 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4444  Flp pilus assembly protein CpaB  30.35 
 
 		 331 aa  45.4  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4660  Flp pilus assembly CpaB  33.33 
 
 		 300 aa  45.4  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000880779  hitchhiker  0.0033273 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0245  SAF domain-containing protein  26.19 
 
 		 306 aa  45.4  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5408  Flp pilus assembly CpaB  29.07 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  26.11 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1402  CpaB family Flp pilus assembly protein  33.06 
 
 		 301 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168447  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1058  Flp pilus assembly protein CpaB  28.57 
 
 		 291 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1518  Flp pilus assembly protein CpaB  27.16 
 
 		 280 aa  43.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  25.56 
 
 		 282 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  25.34 
 
 		 289 aa  42.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1130  SAF domain protein  28.21 
 
 		 280 aa  42.4  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  26.71 
 
 		 288 aa  42.4  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  28.36 
 
 		 269 aa  42  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1485  Flp pilus assembly protein CpaB  25 
 
 		 286 aa  42  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3351  SAF domain-containing protein  27.27 
 
 		 269 aa  42  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1657  Flp pilus assembly CpaB  28.5 
 
 		 342 aa  42  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.255393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>