13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3424 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3424  SAF domain protein  100 
 
 		 244 aa  459  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.34975  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4442  hypothetical protein  47.58 
 
 		 246 aa  172  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0197871 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2923  hypothetical protein  46.28 
 
 		 256 aa  164  9e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00621975  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2637  hypothetical protein  37.74 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2646  SAF domain protein  39.68 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2931  hypothetical protein  37.21 
 
 		 259 aa  144  9e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.59237  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3114  SAF domain-containing protein  33.33 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1854  Flp pilus assembly protein CpaB  29.57 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0981653  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20640  Flp pilus assembly protein CpaB  30.49 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  29.96 
 
 		 284 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  24.23 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  28.65 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  27.88 
 
 		 233 aa  42.4  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>