18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2931 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2931  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  512  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.59237  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2646  SAF domain protein  55.98 
 
 
251 aa  258  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2923  hypothetical protein  46.36 
 
 
256 aa  186  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00621975  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2637  hypothetical protein  37.93 
 
 
258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4442  hypothetical protein  40.54 
 
 
246 aa  154  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0197871 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3424  SAF domain protein  37.21 
 
 
244 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.34975  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3114  SAF domain-containing protein  32.3 
 
 
244 aa  85.9  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1854  Flp pilus assembly protein CpaB  31.74 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0981653  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20640  Flp pilus assembly protein CpaB  32.2 
 
 
273 aa  46.6  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  26.17 
 
 
274 aa  45.8  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1442  Flp pilus assembly protein CpaB  27.06 
 
 
311 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.257298 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0392  Flp pilus assembly CpaB  26.75 
 
 
260 aa  45.4  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.373428  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  24.02 
 
 
234 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0302  Flp pilus assembly CpaB  27.95 
 
 
275 aa  45.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1274  SAF domain protein  28.03 
 
 
237 aa  43.1  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0833437  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  27.69 
 
 
233 aa  43.1  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0953  hypothetical protein  30.14 
 
 
232 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2570  Flp pilus assembly protein CpaB  32.53 
 
 
241 aa  42.4  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0752295  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>