101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0795 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0795  Flp pilus assembly protein CpaB  100 
 
 		 390 aa  794    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1021  Flp pilus assembly protein CpaB  27.45 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  30.77 
 
 		 234 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  29.69 
 
 		 251 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3515  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  34.13 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2012  SAF domain-containing protein  26.89 
 
 		 272 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0418  Flp pilus assembly CpaB  24.37 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  28.99 
 
 		 307 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0609  putative CpaB2 pilus assembly protein  28.1 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.620793  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  31.25 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  38.58 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  26.29 
 
 		 274 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  31.15 
 
 		 233 aa  62.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  28.69 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  25.88 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  26.91 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  26.91 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  26.91 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  27.27 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  26.62 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  27.35 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  28.74 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0792  Flp pilus assembly CpaB  25.35 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0325336  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1080  Flp pilus assembly CpaB  28.93 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3351  SAF domain-containing protein  26.78 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0722  SAF domain-containing protein  26.83 
 
 		 271 aa  57  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268977  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3420  Flp pilus assembly CpaB  26.2 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3927  Flp pilus assembly protein CpaB  26.2 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152772  normal  0.4164 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  30.5 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  30.5 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  30.5 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  30.57 
 
 		 281 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  30.57 
 
 		 281 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1058  Flp pilus assembly protein CpaB  26.87 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1910  putative Flp pilus assembly protein CpaB  30.43 
 
 		 274 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  29.95 
 
 		 279 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2923  hypothetical protein  29.63 
 
 		 256 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00621975  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0558  putative Flp pilus assembly protein CpaB  30.43 
 
 		 274 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3203  Flp pilus assembly protein CpaB  28.38 
 
 		 291 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200873 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3996  pilus assembly protein cpaB  26.19 
 
 		 270 aa  54.3  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  26.87 
 
 		 322 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3006  Flp pilus assembly protein CpaB  27.06 
 
 		 309 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1785  Flp pilus assembly CpaB  25.45 
 
 		 265 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.634606  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2058  Flp pilus assembly CpaB  28.92 
 
 		 342 aa  53.9  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308551  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7030  putative pilus assembly protein, cpaB  26.76 
 
 		 249 aa  53.9  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  0.799048 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  28.87 
 
 		 262 aa  53.5  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5126  SAF domain-containing protein  27.5 
 
 		 263 aa  53.5  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0670857 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1746  Flp pilus assembly protein CpaB  26.43 
 
 		 272 aa  53.1  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  29.44 
 
 		 280 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3519  Flp pilus assembly CpaB  25 
 
 		 266 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0232  SAF domain-containing protein  25.98 
 
 		 250 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2692  Flp pilus assembly protein CpaB  30.27 
 
 		 286 aa  52.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000594167  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  29.53 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2020  SAF domain-containing protein  28.66 
 
 		 275 aa  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4869  SAF domain-containing protein  31.06 
 
 		 332 aa  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  26.82 
 
 		 292 aa  51.2  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0309  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  29.65 
 
 		 274 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0305  SAF domain-containing protein  31.17 
 
 		 309 aa  51.2  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  26.81 
 
 		 283 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1515  Flp pilus assembly CpaB  26.79 
 
 		 260 aa  50.4  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.670297  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1485  Flp pilus assembly protein CpaB  24.65 
 
 		 286 aa  50.4  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4344  Flp pilus assembly protein CpaB  25.95 
 
 		 339 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.684033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0392  Flp pilus assembly CpaB  22.57 
 
 		 260 aa  50.1  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.373428  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  25.55 
 
 		 269 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  25.86 
 
 		 282 aa  49.7  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3114  SAF domain-containing protein  28.99 
 
 		 244 aa  49.7  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2407  Flp pilus assembly protein CpaB  24.71 
 
 		 260 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  27.43 
 
 		 272 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1728  Flp pilus assembly CpaB  29.56 
 
 		 296 aa  49.3  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  25.49 
 
 		 291 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4404  Flp pilus assembly protein CpaB  29.03 
 
 		 305 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0666  Flp pilus assembly protein CpaB  24.89 
 
 		 314 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.406757  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  28.43 
 
 		 289 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  33.33 
 
 		 271 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.658434 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  26.82 
 
 		 264 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1518  Flp pilus assembly protein CpaB  26.21 
 
 		 280 aa  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0245  SAF domain-containing protein  27.98 
 
 		 306 aa  47.8  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4187  Flp pilus assembly protein CpaB  24 
 
 		 271 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  23.45 
 
 		 295 aa  47  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20640  Flp pilus assembly protein CpaB  22.79 
 
 		 273 aa  47  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4475  Flp pilus assembly protein CpaB  23.74 
 
 		 271 aa  46.6  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1130  Flp pilus assembly CpaB  26.46 
 
 		 345 aa  46.2  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0287562  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1513  hypothetical protein  27.27 
 
 		 309 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139808 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4194  Flp pilus assembly protein CpaB  29.29 
 
 		 296 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  27.78 
 
 		 263 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0302  Flp pilus assembly CpaB  22.66 
 
 		 275 aa  45.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  29.29 
 
 		 283 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0894  Flp pilus assembly protein CpaB  25.81 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3712  Flp pilus assembly CpaB  24.28 
 
 		 265 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.241083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4615  Flp pilus assembly protein CpaB  29.84 
 
 		 270 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0998  Flp pilus assembly CpaB  25.71 
 
 		 274 aa  43.9  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.82555 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0069  SAF domain-containing protein  23.74 
 
 		 317 aa  43.9  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723058 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2690  Flp pilus assembly protein CpaB  30.97 
 
 		 338 aa  43.9  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2345  Flp pilus assembly CpaB  26.4 
 
 		 287 aa  43.9  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3486  Flp pilus assembly protein CpaB  25.41 
 
 		 292 aa  43.9  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0314928 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2385  Flp pilus assembly protein CpaB  31.62 
 
 		 268 aa  43.5  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0778  SAF domain protein  30.77 
 
 		 214 aa  43.5  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000467873  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2826  Flp pilus assembly protein CpaB  30.77 
 
 		 267 aa  43.1  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2479  Flp pilus assembly protein CpaB  25.24 
 
 		 261 aa  43.1  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.801269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0750  Flp pilus assembly protein CpaB  23.02 
 
 		 298 aa  43.1  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>