14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0778 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0778  SAF domain protein  100 
 
 
214 aa  410  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000467873  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0804  hypothetical protein  30.19 
 
 
199 aa  58.9  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3203  Flp pilus assembly protein CpaB  27.47 
 
 
291 aa  52  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200873 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0795  Flp pilus assembly protein CpaB  30.77 
 
 
390 aa  51.2  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1058  Flp pilus assembly protein CpaB  28.33 
 
 
291 aa  49.7  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1785  Flp pilus assembly CpaB  28.5 
 
 
265 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.634606  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3519  Flp pilus assembly CpaB  34.43 
 
 
266 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0535  Flp pilus assembly protein CpaB  32.54 
 
 
215 aa  44.3  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2965  SAF domain protein  24.06 
 
 
235 aa  43.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2491  Flp pilus assembly protein CpaB  30.14 
 
 
247 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144514 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0302  Flp pilus assembly CpaB  30.97 
 
 
275 aa  42.4  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  24.81 
 
 
291 aa  42.4  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3712  Flp pilus assembly CpaB  30.24 
 
 
265 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.241083  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0392  Flp pilus assembly CpaB  33.06 
 
 
260 aa  42  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.373428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>