100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0894 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0894  Flp pilus assembly protein CpaB  100 
 
 		 312 aa  619  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0666  Flp pilus assembly protein CpaB  85.03 
 
 		 314 aa  508  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.406757  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2041  Flp pilus assembly protein CpaB  52.04 
 
 		 308 aa  289  4e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.106466  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0305  SAF domain-containing protein  40.25 
 
 		 309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4869  SAF domain-containing protein  36.47 
 
 		 332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1080  Flp pilus assembly CpaB  32.31 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1130  Flp pilus assembly CpaB  35.68 
 
 		 345 aa  106  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0287562  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5682  putative pilus assembly protein cpaB  34.51 
 
 		 266 aa  96.3  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3927  Flp pilus assembly protein CpaB  34.26 
 
 		 342 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152772  normal  0.4164 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3420  Flp pilus assembly CpaB  33.87 
 
 		 342 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1513  hypothetical protein  34.42 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139808 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2690  Flp pilus assembly protein CpaB  31.65 
 
 		 338 aa  90.5  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7030  putative pilus assembly protein, cpaB  32.76 
 
 		 249 aa  89.7  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  0.799048 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2020  SAF domain-containing protein  29.52 
 
 		 275 aa  89.4  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3712  Flp pilus assembly CpaB  31.44 
 
 		 265 aa  89.4  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.241083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2058  Flp pilus assembly CpaB  33.08 
 
 		 342 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308551  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3519  Flp pilus assembly CpaB  33.18 
 
 		 266 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0418  Flp pilus assembly CpaB  29.86 
 
 		 278 aa  85.9  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4615  Flp pilus assembly protein CpaB  28.41 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2460  CpaB family Flp pilus assembly protein  30.42 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0968707  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2385  Flp pilus assembly protein CpaB  34.67 
 
 		 268 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4194  Flp pilus assembly protein CpaB  28.47 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0824  Flp pilus assembly protein CpaB  30.82 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.570609  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1884  putative pilus assembly protein CpaB  30.82 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222645  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0337  Flp pilus assembly CpaB  30.82 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.720767  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1681  Flp pilus assembly protein CpaB  30.82 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2039  CpaB family Flp pilus assembly protein  30.82 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.621232  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1872  putative pilus assembly protein CpaB  30.82 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0392  Flp pilus assembly CpaB  28.9 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.373428  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1785  Flp pilus assembly CpaB  31.34 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.634606  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2826  Flp pilus assembly protein CpaB  30.84 
 
 		 267 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3486  Flp pilus assembly protein CpaB  33.62 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0314928 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  31.18 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.658434 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0302  Flp pilus assembly CpaB  30.04 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0232  SAF domain-containing protein  27.92 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  29.46 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0609  putative CpaB2 pilus assembly protein  28.8 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.620793  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2318  Flp pilus assembly protein CpaB  26.15 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  26.64 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3996  pilus assembly protein cpaB  29.74 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  30.59 
 
 		 292 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  29.65 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  31.8 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0722  SAF domain-containing protein  30 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268977  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  29.49 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  25.87 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0218  component of type IV pilus  28.45 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  29.03 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  26.01 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4404  Flp pilus assembly protein CpaB  29.39 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  31.25 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  29.24 
 
 		 281 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2479  Flp pilus assembly protein CpaB  26.87 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.801269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  29.61 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5126  SAF domain-containing protein  30.36 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0670857 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  26.01 
 
 		 261 aa  54.3  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  27.88 
 
 		 272 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2407  Flp pilus assembly protein CpaB  26.18 
 
 		 260 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3351  SAF domain-containing protein  24.62 
 
 		 269 aa  53.1  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4187  Flp pilus assembly protein CpaB  25.66 
 
 		 271 aa  52.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1728  Flp pilus assembly CpaB  24.73 
 
 		 296 aa  52.8  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  27.51 
 
 		 272 aa  52.4  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  25.3 
 
 		 289 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  28 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2702  Flp pilus assembly protein CpaB  26.61 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  27.81 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  27.27 
 
 		 284 aa  50.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  27.22 
 
 		 266 aa  50.8  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  22.37 
 
 		 274 aa  50.4  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  25.22 
 
 		 291 aa  50.4  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1130  SAF domain protein  29.3 
 
 		 280 aa  50.1  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  28.09 
 
 		 281 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  28.09 
 
 		 281 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  28.09 
 
 		 281 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  26.8 
 
 		 279 aa  50.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  27.4 
 
 		 279 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  28.31 
 
 		 279 aa  49.3  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  28.65 
 
 		 281 aa  49.3  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  28.65 
 
 		 281 aa  49.3  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  27.4 
 
 		 279 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  28.47 
 
 		 262 aa  48.9  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3203  Flp pilus assembly protein CpaB  26.67 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200873 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  27.4 
 
 		 279 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4390  Flp pilus assembly CpaB  28.57 
 
 		 319 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.752776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0792  Flp pilus assembly CpaB  25.97 
 
 		 286 aa  47  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0325336  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6874  Flp pilus assembly protein CpaB  31.5 
 
 		 366 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.367067  normal  0.327856 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0750  Flp pilus assembly protein CpaB  24.15 
 
 		 298 aa  47  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  28.19 
 
 		 295 aa  46.6  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  29.61 
 
 		 307 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1058  Flp pilus assembly protein CpaB  26.59 
 
 		 291 aa  46.2  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2012  SAF domain-containing protein  24.14 
 
 		 272 aa  45.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0245  SAF domain-containing protein  23.77 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2692  Flp pilus assembly protein CpaB  30.77 
 
 		 286 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000594167  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0706  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  23.89 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0795  Flp pilus assembly protein CpaB  25.81 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4475  Flp pilus assembly protein CpaB  28.68 
 
 		 271 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  29.55 
 
 		 322 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1515  Flp pilus assembly CpaB  32.39 
 
 		 260 aa  43.9  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.670297  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1021  Flp pilus assembly protein CpaB  28.3 
 
 		 258 aa  42.7  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1643  Flp pilus assembly CpaB  26.32 
 
 		 299 aa  42.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000168863  normal  0.463494 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>