95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2041 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2041  Flp pilus assembly protein CpaB  100 
 
 		 308 aa  616  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.106466  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0666  Flp pilus assembly protein CpaB  50.94 
 
 		 314 aa  295  7e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.406757  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0894  Flp pilus assembly protein CpaB  51.74 
 
 		 312 aa  291  9e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0305  SAF domain-containing protein  39.31 
 
 		 309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4869  SAF domain-containing protein  35.38 
 
 		 332 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1080  Flp pilus assembly CpaB  31.23 
 
 		 342 aa  112  8.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1130  Flp pilus assembly CpaB  33.03 
 
 		 345 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0287562  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3420  Flp pilus assembly CpaB  33.68 
 
 		 342 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3927  Flp pilus assembly protein CpaB  32.38 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152772  normal  0.4164 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2690  Flp pilus assembly protein CpaB  31.05 
 
 		 338 aa  103  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2058  Flp pilus assembly CpaB  30.96 
 
 		 342 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308551  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0824  Flp pilus assembly protein CpaB  31.21 
 
 		 350 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.570609  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1884  putative pilus assembly protein CpaB  30.14 
 
 		 350 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222645  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1872  putative pilus assembly protein CpaB  31.21 
 
 		 350 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0337  Flp pilus assembly CpaB  31.21 
 
 		 350 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.720767  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1681  Flp pilus assembly protein CpaB  31.21 
 
 		 350 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2039  CpaB family Flp pilus assembly protein  31.21 
 
 		 350 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.621232  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5682  putative pilus assembly protein cpaB  31.8 
 
 		 266 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2020  SAF domain-containing protein  27.36 
 
 		 275 aa  90.1  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4615  Flp pilus assembly protein CpaB  32.39 
 
 		 270 aa  89.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2460  CpaB family Flp pilus assembly protein  36.42 
 
 		 345 aa  89  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0968707  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1513  hypothetical protein  31.78 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139808 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0722  SAF domain-containing protein  29.74 
 
 		 271 aa  86.7  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268977  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7030  putative pilus assembly protein, cpaB  29.31 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  0.799048 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2385  Flp pilus assembly protein CpaB  29.81 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1785  Flp pilus assembly CpaB  29.49 
 
 		 265 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.634606  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3712  Flp pilus assembly CpaB  28.32 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.241083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0392  Flp pilus assembly CpaB  27.65 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.373428  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3519  Flp pilus assembly CpaB  30.28 
 
 		 266 aa  79  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0418  Flp pilus assembly CpaB  26.85 
 
 		 278 aa  79  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  30.53 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.658434 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2826  Flp pilus assembly protein CpaB  29.95 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0302  Flp pilus assembly CpaB  29.1 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4194  Flp pilus assembly protein CpaB  26.99 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3486  Flp pilus assembly protein CpaB  30.94 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0314928 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3996  pilus assembly protein cpaB  28.79 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0232  SAF domain-containing protein  25.88 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2479  Flp pilus assembly protein CpaB  28.06 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.801269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2702  Flp pilus assembly protein CpaB  27.84 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0609  putative CpaB2 pilus assembly protein  27.14 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.620793  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2407  Flp pilus assembly protein CpaB  26.71 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0218  component of type IV pilus  27.38 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  26.48 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1746  Flp pilus assembly protein CpaB  23.22 
 
 		 272 aa  57  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  26.06 
 
 		 283 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  26.25 
 
 		 264 aa  57  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  25.65 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  28.74 
 
 		 251 aa  55.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0649  Flp pilus assembly CpaB  28.07 
 
 		 312 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  25.71 
 
 		 262 aa  54.7  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  25.54 
 
 		 281 aa  53.1  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  26.09 
 
 		 272 aa  52.8  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  23.4 
 
 		 282 aa  52.8  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4187  Flp pilus assembly protein CpaB  26.45 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2318  Flp pilus assembly protein CpaB  26.29 
 
 		 233 aa  52.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  26.04 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  28.57 
 
 		 292 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  27.33 
 
 		 279 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  26.09 
 
 		 281 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  26.09 
 
 		 281 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  26.09 
 
 		 281 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  27.08 
 
 		 263 aa  50.4  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5126  SAF domain-containing protein  23.03 
 
 		 263 aa  50.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0670857 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  26.29 
 
 		 288 aa  49.3  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  26.63 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  26.63 
 
 		 281 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  24.44 
 
 		 272 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  26.63 
 
 		 281 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4660  Flp pilus assembly CpaB  25.75 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000880779  hitchhiker  0.0033273 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3351  SAF domain-containing protein  24.73 
 
 		 269 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  26.98 
 
 		 284 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2311  Flp pilus assembly protein CpaB  24.62 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4390  Flp pilus assembly CpaB  26.3 
 
 		 319 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.752776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  26.78 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  26.47 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  26.47 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  26.47 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  23.88 
 
 		 307 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  24.86 
 
 		 269 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1040  Flp pilus assembly CpaB  26.35 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000512138  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1520  Flp pilus assembly CpaB  26.35 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000592722  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1496  Flp pilus assembly protein CpaB  26.35 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000496809  hitchhiker  0.000000663837 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2073  Flp pilus assembly protein CpaB  30.22 
 
 		 363 aa  47  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10677  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  23.58 
 
 		 274 aa  47  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2012  SAF domain-containing protein  25.4 
 
 		 272 aa  46.2  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  24.71 
 
 		 274 aa  46.2  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4475  Flp pilus assembly protein CpaB  27.57 
 
 		 271 aa  45.8  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1515  Flp pilus assembly CpaB  25.58 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.670297  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55930  putative pilus assembly protein  31.34 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0849  Flp pilus assembly protein CpaB  30.67 
 
 		 315 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1728  Flp pilus assembly CpaB  25.5 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1733  Flp pilus assembly protein CpaB  23.59 
 
 		 313 aa  43.1  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619975  hitchhiker  0.0000143429 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2919  putative Flp pilus assembly CpaB  24.19 
 
 		 363 aa  42.7  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0245  SAF domain-containing protein  23.39 
 
 		 306 aa  42.7  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4850  hypothetical protein  25.84 
 
 		 357 aa  42.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>