83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1021 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1021  Flp pilus assembly protein CpaB  100 
 
 		 258 aa  513  1e-144  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3354  SAF domain-containing protein  29.96 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  30.84 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  32.12 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0795  Flp pilus assembly protein CpaB  27.45 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  30.77 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  31.06 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0535  Flp pilus assembly protein CpaB  33.94 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4153  SAF domain-containing protein  30.08 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  30.61 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  27.78 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20640  Flp pilus assembly protein CpaB  25.82 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1515  Flp pilus assembly CpaB  34.58 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.670297  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  28.22 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0609  putative CpaB2 pilus assembly protein  28.87 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.620793  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0069  SAF domain-containing protein  29.08 
 
 		 317 aa  55.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723058 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  29.03 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  27.11 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5126  SAF domain-containing protein  25.82 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0670857 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0792  Flp pilus assembly CpaB  25.57 
 
 		 286 aa  53.5  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0325336  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3351  SAF domain-containing protein  27.89 
 
 		 269 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  28.71 
 
 		 307 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1854  Flp pilus assembly protein CpaB  26.2 
 
 		 245 aa  53.1  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0981653  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1058  Flp pilus assembly protein CpaB  27.88 
 
 		 291 aa  53.1  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3203  Flp pilus assembly protein CpaB  27.64 
 
 		 291 aa  52.8  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200873 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  30.77 
 
 		 262 aa  52.8  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  29.29 
 
 		 322 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  28.21 
 
 		 292 aa  52.4  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  28.51 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  26.39 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  25.53 
 
 		 282 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1757  Flp pilus assembly protein CpaB  34.95 
 
 		 243 aa  50.4  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.336594  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0392  Flp pilus assembly CpaB  27.69 
 
 		 260 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.373428  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  28.99 
 
 		 263 aa  50.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3006  Flp pilus assembly protein CpaB  27.69 
 
 		 309 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1518  Flp pilus assembly protein CpaB  29.35 
 
 		 280 aa  49.3  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  24.38 
 
 		 279 aa  49.3  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  23.6 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  25.23 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0302  Flp pilus assembly CpaB  26.24 
 
 		 275 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  23.6 
 
 		 279 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  23.6 
 
 		 279 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  25 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4404  Flp pilus assembly protein CpaB  28.46 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13180  SAF domain-containing protein  30.21 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1485  Flp pilus assembly protein CpaB  26.4 
 
 		 286 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4444  Flp pilus assembly protein CpaB  28.03 
 
 		 331 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4194  Flp pilus assembly protein CpaB  25.75 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  24.38 
 
 		 281 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3519  Flp pilus assembly CpaB  27.08 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  25 
 
 		 281 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1657  Flp pilus assembly CpaB  31.64 
 
 		 342 aa  47  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.255393  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  25 
 
 		 281 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  25 
 
 		 281 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2318  Flp pilus assembly protein CpaB  31.19 
 
 		 233 aa  47  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1208  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  26.4 
 
 		 253 aa  47  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000207923  decreased coverage  8.378480000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0750  Flp pilus assembly protein CpaB  25.51 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0722  SAF domain-containing protein  27.2 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268977  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1442  Flp pilus assembly protein CpaB  27.57 
 
 		 311 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257298 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  25.13 
 
 		 291 aa  45.4  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  25 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  27.69 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4850  hypothetical protein  30.99 
 
 		 357 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  23.97 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1643  Flp pilus assembly CpaB  26.24 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000168863  normal  0.463494 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3996  pilus assembly protein cpaB  27.91 
 
 		 270 aa  43.5  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2271  hypothetical protein  25.68 
 
 		 258 aa  43.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250803  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02596  signal peptide protein  31.39 
 
 		 208 aa  43.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  26.96 
 
 		 264 aa  43.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2826  Flp pilus assembly protein CpaB  26.47 
 
 		 267 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4344  Flp pilus assembly protein CpaB  23.26 
 
 		 339 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.684033  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  24.8 
 
 		 288 aa  43.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7030  putative pilus assembly protein, cpaB  25.56 
 
 		 249 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  0.799048 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0706  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  25.38 
 
 		 298 aa  43.1  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  24.76 
 
 		 283 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2020  SAF domain-containing protein  26.43 
 
 		 275 aa  42.7  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0202  hypothetical secreted protein  29.41 
 
 		 303 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0883  Flp pilus assembly protein CpaB  30.15 
 
 		 432 aa  42.4  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0894  Flp pilus assembly protein CpaB  30.06 
 
 		 312 aa  42.4  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1080  Flp pilus assembly CpaB  28.02 
 
 		 342 aa  42.4  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2692  Flp pilus assembly protein CpaB  24.02 
 
 		 286 aa  42.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000594167  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  27.48 
 
 		 271 aa  42.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.658434 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  29.05 
 
 		 283 aa  42  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>