131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3515 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3515  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  100 
 
 		 293 aa  558  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0069  SAF domain-containing protein  34.39 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723058 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0795  Flp pilus assembly protein CpaB  34.13 
 
 		 390 aa  75.9  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1442  Flp pilus assembly protein CpaB  32.41 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257298 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1733  Flp pilus assembly protein CpaB  31.23 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619975  hitchhiker  0.0000143429 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  34.13 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  31.47 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  26.97 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2799  putative signal peptide protein, CpaB like  31.2 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  28.46 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  31.93 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  32.84 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1728  Flp pilus assembly CpaB  28.9 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  28.2 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4357  Flp pilus assembly protein CpaB  29.46 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4247  Flp pilus assembly protein CpaB  29.46 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.262876 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1402  CpaB family Flp pilus assembly protein  30.16 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168447  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4660  Flp pilus assembly CpaB  33.06 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000880779  hitchhiker  0.0033273 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  31.15 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  31.2 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1058  Flp pilus assembly protein CpaB  29.47 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4404  Flp pilus assembly protein CpaB  28.09 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3203  Flp pilus assembly protein CpaB  29.56 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200873 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1652  Flp pilus assembly protein CpaB  28.63 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  28.72 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2407  Flp pilus assembly protein CpaB  30.4 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7030  putative pilus assembly protein, cpaB  27.11 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  0.799048 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  33.5 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  28.1 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1746  Flp pilus assembly protein CpaB  29.2 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  28.27 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  28.79 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2702  Flp pilus assembly protein CpaB  32.79 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5408  Flp pilus assembly CpaB  30.54 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1040  Flp pilus assembly CpaB  31.05 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000512138  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1520  Flp pilus assembly CpaB  31.05 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000592722  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2012  SAF domain-containing protein  32.79 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2479  Flp pilus assembly protein CpaB  31.23 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.801269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1496  Flp pilus assembly protein CpaB  31.05 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000496809  hitchhiker  0.000000663837 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1130  Flp pilus assembly CpaB  30.81 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0287562  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4869  SAF domain-containing protein  30.92 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0792  Flp pilus assembly CpaB  29.21 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0325336  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2385  Flp pilus assembly protein CpaB  30.22 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1080  Flp pilus assembly CpaB  27.24 
 
 		 342 aa  55.8  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0609  putative CpaB2 pilus assembly protein  28.63 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.620793  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3006  Flp pilus assembly protein CpaB  34.94 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0706  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  33.61 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0232  SAF domain-containing protein  27.93 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  26.81 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4444  Flp pilus assembly protein CpaB  27.05 
 
 		 331 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  26.42 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  26.42 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2320  Flp pilus assembly protein CpaB  30.91 
 
 		 345 aa  53.9  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0418  Flp pilus assembly CpaB  31.37 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  30.53 
 
 		 263 aa  53.5  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2073  Flp pilus assembly protein CpaB  26.21 
 
 		 363 aa  53.5  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10677  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  33.81 
 
 		 271 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.658434 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2163  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  28.57 
 
 		 316 aa  52.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143104 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1518  Flp pilus assembly protein CpaB  29.44 
 
 		 280 aa  52.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2327  Flp pilus assembly protein CpaB  32.16 
 
 		 323 aa  53.1  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.296928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2705  hypothetical protein  32.16 
 
 		 323 aa  53.1  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.787376  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1643  Flp pilus assembly CpaB  24.18 
 
 		 299 aa  52.8  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000168863  normal  0.463494 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1130  SAF domain protein  29.15 
 
 		 280 aa  52.4  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  25.61 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  26.5 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0998  Flp pilus assembly CpaB  25.98 
 
 		 274 aa  52.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.82555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5682  putative pilus assembly protein cpaB  28.19 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  28.24 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  28.12 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  28.04 
 
 		 281 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  25.77 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1767  putative pilus assembly protein CpaB  28.41 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.726426  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  28.04 
 
 		 281 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2826  Flp pilus assembly protein CpaB  29 
 
 		 267 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  24.1 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1940  CpaB family Flp pilus assembly protein  28.03 
 
 		 348 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0235089  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  28.35 
 
 		 279 aa  49.7  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1788  putative pilus assembly protein CpaB  28.03 
 
 		 299 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  31.93 
 
 		 280 aa  49.3  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  27.69 
 
 		 281 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  28.14 
 
 		 283 aa  49.3  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  27.69 
 
 		 281 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  27.69 
 
 		 281 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1757  Flp pilus assembly protein CpaB  35 
 
 		 243 aa  49.3  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.336594  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1291  hypothetical protein  27.27 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0302  Flp pilus assembly CpaB  30.07 
 
 		 275 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2543  CpaB family Flp pilus assembly protein  28 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  31.09 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1779  hypothetical protein  27.27 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0245  SAF domain-containing protein  31.75 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0116  hypothetical protein  27.27 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1049  putative pilus assembly protein CpaB  27.27 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.342434  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0646  SAF domain-containing protein  28.66 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.361703 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1208  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  31.82 
 
 		 253 aa  48.5  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000207923  decreased coverage  8.378480000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3519  Flp pilus assembly CpaB  27.47 
 
 		 266 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3653  pilus assembly protein  30 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.588333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3420  Flp pilus assembly CpaB  35.66 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4194  Flp pilus assembly protein CpaB  30.86 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3927  Flp pilus assembly protein CpaB  35.66 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152772  normal  0.4164 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1657  Flp pilus assembly CpaB  29.43 
 
 		 342 aa  47.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.255393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>