40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_20640 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_20640  Flp pilus assembly protein CpaB  100 
 
 		 273 aa  541  1e-153  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0535  Flp pilus assembly protein CpaB  53.55 
 
 		 215 aa  194  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13180  SAF domain-containing protein  45.28 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1036  SAF domain protein  29.13 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1021  Flp pilus assembly protein CpaB  25.82 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3354  SAF domain-containing protein  27.88 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4153  SAF domain-containing protein  27.81 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  28.95 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  29.79 
 
 		 295 aa  57  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3114  SAF domain-containing protein  30.26 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  25 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1515  Flp pilus assembly CpaB  29.61 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.670297  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  25.51 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2012  SAF domain-containing protein  24.48 
 
 		 272 aa  53.1  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  24.67 
 
 		 272 aa  52.8  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  29.28 
 
 		 307 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  24.68 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  27.81 
 
 		 289 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3424  SAF domain protein  30.48 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.34975  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2923  hypothetical protein  32.8 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00621975  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0218  component of type IV pilus  33.33 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  28.29 
 
 		 322 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0795  Flp pilus assembly protein CpaB  22.79 
 
 		 390 aa  47.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2931  hypothetical protein  32.2 
 
 		 259 aa  47  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.59237  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  28.73 
 
 		 307 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0558  putative Flp pilus assembly protein CpaB  26.14 
 
 		 274 aa  46.2  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2318  Flp pilus assembly protein CpaB  24.5 
 
 		 233 aa  45.8  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1910  putative Flp pilus assembly protein CpaB  26.14 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  27.36 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2637  hypothetical protein  33.16 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3203  Flp pilus assembly protein CpaB  22.88 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200873 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4442  hypothetical protein  37.89 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0197871 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1746  Flp pilus assembly protein CpaB  25.37 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  26.54 
 
 		 281 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  26.54 
 
 		 281 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  26.54 
 
 		 281 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  25.57 
 
 		 274 aa  43.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3274  SAF domain protein  29.06 
 
 		 218 aa  42.7  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.785006  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2566  Flp pilus assembly protein CpaB  29.38 
 
 		 307 aa  42  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  30.56 
 
 		 279 aa  42  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>