144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1657 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1657  Flp pilus assembly CpaB  100 
 
 
342 aa  667    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.255393  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1643  Flp pilus assembly CpaB  30.34 
 
 
299 aa  96.7  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000168863  normal  0.463494 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2163  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  31.4 
 
 
316 aa  96.3  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.143104 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1442  Flp pilus assembly protein CpaB  34.66 
 
 
311 aa  95.9  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.257298 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4660  Flp pilus assembly CpaB  35.86 
 
 
300 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000880779  hitchhiker  0.0033273 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4390  Flp pilus assembly CpaB  33.08 
 
 
319 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.752776  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4850  hypothetical protein  32.58 
 
 
357 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2799  putative signal peptide protein, CpaB like  34.58 
 
 
316 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1040  Flp pilus assembly CpaB  34.66 
 
 
301 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000512138  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1520  Flp pilus assembly CpaB  34.66 
 
 
301 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000592722  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1733  Flp pilus assembly protein CpaB  34 
 
 
313 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619975  hitchhiker  0.0000143429 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1496  Flp pilus assembly protein CpaB  34.66 
 
 
301 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000496809  hitchhiker  0.000000663837 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5408  Flp pilus assembly CpaB  33.75 
 
 
318 aa  86.3  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1940  CpaB family Flp pilus assembly protein  33.58 
 
 
348 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0235089  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1788  putative pilus assembly protein CpaB  33.21 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4872  Flp pilus assembly protein CpaB  35.19 
 
 
303 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55930  putative pilus assembly protein  34.17 
 
 
303 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319663  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0849  Flp pilus assembly protein CpaB  33.48 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1291  hypothetical protein  32.83 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1779  hypothetical protein  32.83 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0116  hypothetical protein  32.83 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1049  putative pilus assembly protein CpaB  32.83 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.342434  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1767  putative pilus assembly protein CpaB  32.32 
 
 
299 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.726426  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  29.34 
 
 
251 aa  82  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1402  CpaB family Flp pilus assembly protein  35.48 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168447  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2543  CpaB family Flp pilus assembly protein  34.75 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  30.69 
 
 
289 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4444  Flp pilus assembly protein CpaB  34.48 
 
 
331 aa  80.1  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1652  Flp pilus assembly protein CpaB  35.15 
 
 
316 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0649  Flp pilus assembly CpaB  31.67 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  31.31 
 
 
281 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  31.31 
 
 
281 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  31.31 
 
 
281 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4247  Flp pilus assembly protein CpaB  34.03 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.262876 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  33.67 
 
 
322 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4357  Flp pilus assembly protein CpaB  34.03 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  30.81 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  35.47 
 
 
307 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  35.07 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  27.55 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  29.63 
 
 
274 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  27.38 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  31.31 
 
 
279 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2073  Flp pilus assembly protein CpaB  30.74 
 
 
363 aa  67  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10677  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2566  Flp pilus assembly protein CpaB  32.2 
 
 
307 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0609  putative CpaB2 pilus assembly protein  32.26 
 
 
267 aa  65.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.620793  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  29.03 
 
 
282 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1518  Flp pilus assembly protein CpaB  32.34 
 
 
280 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1058  Flp pilus assembly protein CpaB  29.01 
 
 
291 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  29.95 
 
 
279 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  29.29 
 
 
261 aa  64.3  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  30.96 
 
 
279 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  30.96 
 
 
279 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3203  Flp pilus assembly protein CpaB  29.01 
 
 
291 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200873 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3653  pilus assembly protein  38.6 
 
 
319 aa  63.5  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.588333  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  29.41 
 
 
269 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  31.76 
 
 
281 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  31.22 
 
 
292 aa  63.2  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  31.76 
 
 
281 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4187  Flp pilus assembly protein CpaB  28.44 
 
 
271 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3351  SAF domain-containing protein  29.85 
 
 
269 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2012  SAF domain-containing protein  28.09 
 
 
272 aa  61.6  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  28.77 
 
 
280 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2020  SAF domain-containing protein  30.51 
 
 
275 aa  60.8  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  29.86 
 
 
272 aa  59.7  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  32.24 
 
 
272 aa  59.3  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  29.31 
 
 
283 aa  59.3  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4344  Flp pilus assembly protein CpaB  34.97 
 
 
339 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.684033  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  29.55 
 
 
288 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  28.02 
 
 
274 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  28.5 
 
 
284 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0218  component of type IV pilus  32.32 
 
 
269 aa  57.4  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2826  Flp pilus assembly protein CpaB  35.98 
 
 
267 aa  57  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1021  Flp pilus assembly protein CpaB  31.64 
 
 
258 aa  57  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4153  SAF domain-containing protein  29.46 
 
 
267 aa  57  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1513  hypothetical protein  29.06 
 
 
309 aa  56.2  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.139808 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0792  Flp pilus assembly CpaB  33.54 
 
 
286 aa  55.8  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0325336  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4475  Flp pilus assembly protein CpaB  28.89 
 
 
271 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156663  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2702  Flp pilus assembly protein CpaB  28.41 
 
 
261 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2327  Flp pilus assembly protein CpaB  30.05 
 
 
323 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.296928  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2705  hypothetical protein  30.05 
 
 
323 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.787376  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  28.57 
 
 
281 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  31.31 
 
 
283 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  32.37 
 
 
271 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.658434 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2407  Flp pilus assembly protein CpaB  28.4 
 
 
260 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1910  putative Flp pilus assembly protein CpaB  36.84 
 
 
274 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0558  putative Flp pilus assembly protein CpaB  36.84 
 
 
274 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  31.82 
 
 
234 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2479  Flp pilus assembly protein CpaB  30.61 
 
 
261 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.801269  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0418  Flp pilus assembly CpaB  27.27 
 
 
278 aa  53.5  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5126  SAF domain-containing protein  29.54 
 
 
263 aa  53.5  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0670857 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2385  Flp pilus assembly protein CpaB  34.97 
 
 
268 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3006  Flp pilus assembly protein CpaB  36.99 
 
 
309 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0722  SAF domain-containing protein  29.49 
 
 
271 aa  52.8  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268977  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1746  Flp pilus assembly protein CpaB  26.72 
 
 
272 aa  52.8  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1884  putative pilus assembly protein CpaB  33.11 
 
 
350 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222645  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1817  Flp pilus assembly protein CpaB  31.51 
 
 
334 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.745683  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3927  Flp pilus assembly protein CpaB  34.48 
 
 
342 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152772  normal  0.4164 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1681  Flp pilus assembly protein CpaB  33.11 
 
 
350 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0337  Flp pilus assembly CpaB  33.11 
 
 
350 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.720767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>