128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2163 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2163  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  100 
 
 		 316 aa  610  1e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55930  putative pilus assembly protein  41.76 
 
 		 303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0649  Flp pilus assembly CpaB  35.6 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4872  Flp pilus assembly protein CpaB  37.66 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4390  Flp pilus assembly CpaB  33.2 
 
 		 319 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.752776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1643  Flp pilus assembly CpaB  31.6 
 
 		 299 aa  102  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000168863  normal  0.463494 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4850  hypothetical protein  29.86 
 
 		 357 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0849  Flp pilus assembly protein CpaB  36.93 
 
 		 315 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4247  Flp pilus assembly protein CpaB  39.8 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.262876 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4357  Flp pilus assembly protein CpaB  39.8 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5408  Flp pilus assembly CpaB  37.57 
 
 		 318 aa  90.9  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1040  Flp pilus assembly CpaB  36.08 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000512138  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1520  Flp pilus assembly CpaB  36.08 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000592722  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1496  Flp pilus assembly protein CpaB  36.08 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000496809  hitchhiker  0.000000663837 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4660  Flp pilus assembly CpaB  36.08 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000880779  hitchhiker  0.0033273 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1657  Flp pilus assembly CpaB  31.4 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.255393  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1733  Flp pilus assembly protein CpaB  30.16 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619975  hitchhiker  0.0000143429 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4444  Flp pilus assembly protein CpaB  30.71 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1767  putative pilus assembly protein CpaB  35 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.726426  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2799  putative signal peptide protein, CpaB like  32.41 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3653  pilus assembly protein  38.1 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.588333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2543  CpaB family Flp pilus assembly protein  36.79 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1940  CpaB family Flp pilus assembly protein  34.55 
 
 		 348 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0235089  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1652  Flp pilus assembly protein CpaB  32.52 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1788  putative pilus assembly protein CpaB  34.55 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  27.85 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1442  Flp pilus assembly protein CpaB  32.49 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257298 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1291  hypothetical protein  34.09 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1779  hypothetical protein  34.09 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0116  hypothetical protein  34.09 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1049  putative pilus assembly protein CpaB  34.09 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.342434  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1402  CpaB family Flp pilus assembly protein  35.57 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168447  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  31.52 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02596  signal peptide protein  39.73 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818766 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  31.28 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  27.32 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  32.91 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2073  Flp pilus assembly protein CpaB  30.99 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10677  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  28.8 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2012  SAF domain-containing protein  29.22 
 
 		 272 aa  62.4  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  26.88 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  37.74 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  32.38 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  33.93 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0069  SAF domain-containing protein  29.85 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723058 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  26.6 
 
 		 261 aa  55.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2318  Flp pilus assembly protein CpaB  26.83 
 
 		 233 aa  55.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  26.25 
 
 		 269 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  31.82 
 
 		 272 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  25.52 
 
 		 279 aa  53.9  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  25.81 
 
 		 283 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  27.95 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  24.69 
 
 		 289 aa  53.9  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  26.04 
 
 		 281 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  26.04 
 
 		 281 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  26.04 
 
 		 281 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  30.56 
 
 		 283 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0750  Flp pilus assembly protein CpaB  26.53 
 
 		 298 aa  52.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  26.94 
 
 		 279 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1080  Flp pilus assembly CpaB  29.03 
 
 		 342 aa  51.6  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2919  putative Flp pilus assembly CpaB  30.82 
 
 		 363 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  32.41 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0998  Flp pilus assembly CpaB  34.82 
 
 		 274 aa  50.8  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.82555 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  32.08 
 
 		 274 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1518  Flp pilus assembly protein CpaB  28.72 
 
 		 280 aa  50.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0218  component of type IV pilus  32.89 
 
 		 269 aa  50.8  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0245  SAF domain-containing protein  26.18 
 
 		 306 aa  50.4  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  24.19 
 
 		 279 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  24.19 
 
 		 279 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0646  SAF domain-containing protein  28.81 
 
 		 298 aa  49.7  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.361703 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4404  Flp pilus assembly protein CpaB  30.25 
 
 		 305 aa  49.7  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  29.41 
 
 		 280 aa  49.3  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1746  Flp pilus assembly protein CpaB  29.03 
 
 		 272 aa  49.3  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0418  Flp pilus assembly CpaB  35.29 
 
 		 278 aa  49.3  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  24.19 
 
 		 279 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3203  Flp pilus assembly protein CpaB  27.27 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7030  putative pilus assembly protein, cpaB  32.24 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  0.799048 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0232  SAF domain-containing protein  27.92 
 
 		 250 aa  48.9  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  24.4 
 
 		 284 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1058  Flp pilus assembly protein CpaB  32.11 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0305  SAF domain-containing protein  29.44 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3712  Flp pilus assembly CpaB  33.05 
 
 		 265 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.241083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2345  Flp pilus assembly CpaB  35.83 
 
 		 287 aa  47.4  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1130  Flp pilus assembly CpaB  30.18 
 
 		 345 aa  47  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0287562  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  26.34 
 
 		 281 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2702  Flp pilus assembly protein CpaB  28.33 
 
 		 261 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2479  Flp pilus assembly protein CpaB  28.33 
 
 		 261 aa  47  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.801269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  26.34 
 
 		 281 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  30.09 
 
 		 282 aa  47  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4671  SAF domain-containing protein  36.45 
 
 		 218 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.116757  normal  0.638971 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3351  SAF domain-containing protein  33.33 
 
 		 269 aa  46.6  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2320  Flp pilus assembly protein CpaB  33.93 
 
 		 345 aa  46.6  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3519  Flp pilus assembly CpaB  32.41 
 
 		 266 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1884  putative pilus assembly protein CpaB  29.33 
 
 		 350 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222645  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0302  Flp pilus assembly CpaB  30.22 
 
 		 275 aa  46.2  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2039  CpaB family Flp pilus assembly protein  29.33 
 
 		 350 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.621232  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3006  Flp pilus assembly protein CpaB  42.31 
 
 		 309 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1681  Flp pilus assembly protein CpaB  29.33 
 
 		 350 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0337  Flp pilus assembly CpaB  29.33 
 
 		 350 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.720767  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4194  Flp pilus assembly protein CpaB  34.55 
 
 		 296 aa  46.2  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>