43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1854 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1854  Flp pilus assembly protein CpaB  100 
 
 		 245 aa  481  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0981653  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3114  SAF domain-containing protein  34.63 
 
 		 244 aa  89  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2931  hypothetical protein  29.32 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.59237  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2923  hypothetical protein  31.51 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00621975  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2637  hypothetical protein  25.56 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4442  hypothetical protein  29.39 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0197871 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  31.64 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  27.8 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3996  pilus assembly protein cpaB  29.84 
 
 		 270 aa  55.1  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0392  Flp pilus assembly CpaB  27.73 
 
 		 260 aa  53.1  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.373428  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1021  Flp pilus assembly protein CpaB  26.2 
 
 		 258 aa  53.1  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2311  Flp pilus assembly protein CpaB  24.54 
 
 		 258 aa  52.8  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0302  Flp pilus assembly CpaB  26.51 
 
 		 275 aa  52  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  26.7 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2646  SAF domain protein  27.1 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  27.23 
 
 		 291 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7030  putative pilus assembly protein, cpaB  27.27 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  0.799048 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3424  SAF domain protein  30.17 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.34975  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  29.89 
 
 		 261 aa  50.1  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3712  Flp pilus assembly CpaB  26.29 
 
 		 265 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.241083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2318  Flp pilus assembly protein CpaB  22.64 
 
 		 233 aa  49.3  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  29.53 
 
 		 288 aa  49.3  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  23.18 
 
 		 274 aa  48.9  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  29.3 
 
 		 263 aa  48.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0722  SAF domain-containing protein  28.5 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268977  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1058  Flp pilus assembly protein CpaB  26.01 
 
 		 291 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3203  Flp pilus assembly protein CpaB  28.88 
 
 		 291 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1785  Flp pilus assembly CpaB  26.14 
 
 		 265 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.634606  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  32.35 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  29.66 
 
 		 283 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5682  putative pilus assembly protein cpaB  30.08 
 
 		 266 aa  46.2  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4615  Flp pilus assembly protein CpaB  28.09 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0535  Flp pilus assembly protein CpaB  28.03 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  27.03 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0054  hypothetical protein  27.03 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0084  Flp pilus assembly protein CpaB  27.03 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0112  Flp pilus assembly protein CpaB  27.03 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.633744  hitchhiker  0.0000176028 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  28.02 
 
 		 271 aa  43.5  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.658434 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2867  hypothetical protein  25.22 
 
 		 213 aa  43.5  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  27.96 
 
 		 284 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20640  Flp pilus assembly protein CpaB  26.2 
 
 		 273 aa  43.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4344  Flp pilus assembly protein CpaB  26.7 
 
 		 339 aa  42.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.684033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  29.7 
 
 		 233 aa  42  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>