39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0903 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0903  SAF domain protein  100 
 
 		 378 aa  703    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8655  hypothetical protein  54.72 
 
 		 205 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3193  SAF domain-containing protein  52.5 
 
 		 212 aa  96.7  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2867  hypothetical protein  42.65 
 
 		 213 aa  95.5  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0369  hypothetical protein  49.34 
 
 		 214 aa  88.2  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.368069  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2574  SAF domain protein  42.86 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000552544 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4293  hypothetical protein  44.62 
 
 		 218 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4379  SAF domain-containing protein  44.62 
 
 		 218 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0786  SAF domain-containing protein  49.02 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4090  SAF domain protein  43.2 
 
 		 218 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30600  SAF domain-containing protein  39.55 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0434873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3695  SAF domain protein  47.42 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000324838  normal  0.905641 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0157  hypothetical protein  42.15 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0163082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4671  SAF domain-containing protein  43.14 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.116757  normal  0.638971 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11008  hypothetical protein  41.48 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0302617  normal  0.278948 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4647  SAF domain protein  48.15 
 
 		 219 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3274  SAF domain protein  39.06 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.785006  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4836  SAF domain-containing protein  40.77 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32700  SAF domain-containing protein  42.86 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.601677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0874  Flp pilus assembly protein CpaB  45.05 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.542829  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1894  SAF domain-containing protein  42.86 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.832512  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0625  SAF domain protein  37.98 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  31.58 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2816  SAF domain protein  36.03 
 
 		 227 aa  55.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.104035  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0901  SAF domain protein  38.53 
 
 		 207 aa  54.7  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1409  SAF domain protein  39.22 
 
 		 220 aa  53.5  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  38.1 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  33.62 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  31.21 
 
 		 251 aa  48.1  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  29.88 
 
 		 274 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  37.14 
 
 		 307 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  28.37 
 
 		 289 aa  46.6  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1652  Flp pilus assembly protein CpaB  31.43 
 
 		 316 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3927  Flp pilus assembly protein CpaB  32 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152772  normal  0.4164 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  32.17 
 
 		 272 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3420  Flp pilus assembly CpaB  32 
 
 		 342 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2058  Flp pilus assembly CpaB  35.65 
 
 		 342 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308551  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  35.38 
 
 		 292 aa  43.1  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0770  SAF domain protein  31.25 
 
 		 221 aa  42.7  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>