59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0874 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0874  Flp pilus assembly protein CpaB  100 
 
 		 215 aa  372  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.542829  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2867  hypothetical protein  32.11 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32700  SAF domain-containing protein  37.71 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.601677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8655  hypothetical protein  44.24 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0786  SAF domain-containing protein  40.25 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3193  SAF domain-containing protein  40 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0157  hypothetical protein  47.75 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0163082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1409  SAF domain protein  41.57 
 
 		 220 aa  72  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0903  SAF domain protein  46.73 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  34.24 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2574  SAF domain protein  36.56 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000552544 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  36 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2816  SAF domain protein  39.62 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.104035  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  32.58 
 
 		 307 aa  61.6  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4647  SAF domain protein  38.89 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4379  SAF domain-containing protein  42.66 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4293  hypothetical protein  42.66 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0369  hypothetical protein  40.72 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.368069  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11008  hypothetical protein  42.42 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0302617  normal  0.278948 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  32.16 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  30.95 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2799  putative signal peptide protein, CpaB like  34.75 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4836  SAF domain-containing protein  39.86 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0625  SAF domain protein  40 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  33.88 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  32.02 
 
 		 307 aa  55.1  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  32.41 
 
 		 272 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30600  SAF domain-containing protein  38.36 
 
 		 261 aa  52.4  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0434873  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3274  SAF domain protein  35.61 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.785006  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0770  SAF domain protein  35.71 
 
 		 221 aa  52  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1894  SAF domain-containing protein  37.42 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.832512  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1652  Flp pilus assembly protein CpaB  33.33 
 
 		 316 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4671  SAF domain-containing protein  44.66 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.116757  normal  0.638971 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  29.52 
 
 		 289 aa  50.1  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  31.16 
 
 		 282 aa  48.1  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0069  SAF domain-containing protein  35.34 
 
 		 317 aa  48.1  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723058 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  34.29 
 
 		 283 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0901  SAF domain protein  33.53 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1021  Flp pilus assembly protein CpaB  35.51 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1746  Flp pilus assembly protein CpaB  31.34 
 
 		 272 aa  47  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2058  Flp pilus assembly CpaB  39.55 
 
 		 342 aa  45.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308551  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  29.1 
 
 		 291 aa  45.4  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4153  SAF domain-containing protein  31.19 
 
 		 267 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3927  Flp pilus assembly protein CpaB  35.84 
 
 		 342 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152772  normal  0.4164 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2345  Flp pilus assembly CpaB  25.6 
 
 		 287 aa  43.5  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1643  Flp pilus assembly CpaB  29.06 
 
 		 299 aa  43.9  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000168863  normal  0.463494 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  31.62 
 
 		 280 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1518  Flp pilus assembly protein CpaB  30.84 
 
 		 280 aa  43.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2491  Flp pilus assembly protein CpaB  27.47 
 
 		 247 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144514 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  29.51 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  32.35 
 
 		 281 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3420  Flp pilus assembly CpaB  35.84 
 
 		 342 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1402  CpaB family Flp pilus assembly protein  31.03 
 
 		 301 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168447  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  30.07 
 
 		 284 aa  42.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  30.28 
 
 		 279 aa  42.4  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3203  Flp pilus assembly protein CpaB  31.82 
 
 		 291 aa  42.4  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200873 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0649  Flp pilus assembly CpaB  37.5 
 
 		 312 aa  42.4  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4404  Flp pilus assembly protein CpaB  27.83 
 
 		 305 aa  42  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  24.86 
 
 		 251 aa  41.6  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>