57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2491 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2491  Flp pilus assembly protein CpaB  100 
 
 		 247 aa  490  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144514 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  31.52 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  28.36 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  28.23 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  29.95 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  27.49 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  29.47 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  29.47 
 
 		 281 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  29.47 
 
 		 281 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  29.47 
 
 		 281 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  28.02 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  28.05 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  27.86 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  29.03 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  26.92 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  26.47 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  25.51 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  26.76 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  26.76 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  26.89 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1518  Flp pilus assembly protein CpaB  27.56 
 
 		 280 aa  53.1  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  29.87 
 
 		 281 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  29.87 
 
 		 281 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0609  putative CpaB2 pilus assembly protein  33.54 
 
 		 267 aa  52.4  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.620793  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2566  Flp pilus assembly protein CpaB  28.96 
 
 		 307 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4869  SAF domain-containing protein  28.67 
 
 		 332 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  25.96 
 
 		 288 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1080  Flp pilus assembly CpaB  29.32 
 
 		 342 aa  50.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4850  hypothetical protein  29.47 
 
 		 357 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1746  Flp pilus assembly protein CpaB  27.46 
 
 		 272 aa  50.4  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2012  SAF domain-containing protein  24.42 
 
 		 272 aa  49.7  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  27.91 
 
 		 263 aa  49.3  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  30.82 
 
 		 280 aa  48.5  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1442  Flp pilus assembly protein CpaB  31.82 
 
 		 311 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257298 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0792  Flp pilus assembly CpaB  26.72 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0325336  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2702  Flp pilus assembly protein CpaB  27.76 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0232  SAF domain-containing protein  29.58 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1733  Flp pilus assembly protein CpaB  25.28 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619975  hitchhiker  0.0000143429 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  25.96 
 
 		 269 aa  47  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  27.47 
 
 		 281 aa  46.6  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  25.95 
 
 		 283 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  25.42 
 
 		 283 aa  45.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2479  Flp pilus assembly protein CpaB  26.98 
 
 		 261 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.801269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55930  putative pilus assembly protein  26.18 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5682  putative pilus assembly protein cpaB  26.23 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3203  Flp pilus assembly protein CpaB  28.29 
 
 		 291 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200873 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3927  Flp pilus assembly protein CpaB  28 
 
 		 342 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152772  normal  0.4164 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2543  CpaB family Flp pilus assembly protein  30.1 
 
 		 292 aa  43.5  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1195  hypothetical protein  27.89 
 
 		 238 aa  43.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3420  Flp pilus assembly CpaB  28 
 
 		 342 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0778  SAF domain protein  28.87 
 
 		 214 aa  42.7  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000467873  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  24.77 
 
 		 289 aa  42.7  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3006  Flp pilus assembly protein CpaB  29.39 
 
 		 309 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4872  Flp pilus assembly protein CpaB  27.23 
 
 		 303 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1058  Flp pilus assembly protein CpaB  28.29 
 
 		 291 aa  42.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  24.35 
 
 		 274 aa  42  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2826  Flp pilus assembly protein CpaB  26.16 
 
 		 267 aa  42  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>