23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11008 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11008  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  409  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0302617  normal  0.278948 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4293  hypothetical protein  62.27 
 
 		 218 aa  238  5e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4379  SAF domain-containing protein  62.27 
 
 		 218 aa  238  5e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4836  SAF domain-containing protein  61.4 
 
 		 217 aa  215  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4671  SAF domain-containing protein  62.27 
 
 		 218 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.116757  normal  0.638971 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1894  SAF domain-containing protein  62.5 
 
 		 217 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.832512  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3274  SAF domain protein  43.42 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.785006  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1409  SAF domain protein  37.9 
 
 		 220 aa  97.8  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0786  SAF domain-containing protein  46.94 
 
 		 211 aa  72  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32700  SAF domain-containing protein  36.05 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.601677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0903  SAF domain protein  43.56 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2867  hypothetical protein  32.4 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8655  hypothetical protein  34.88 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0369  hypothetical protein  39.31 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.368069  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0157  hypothetical protein  43.14 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0163082  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3193  SAF domain-containing protein  41.58 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4647  SAF domain protein  39.71 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3695  SAF domain protein  38.27 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000324838  normal  0.905641 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2574  SAF domain protein  32.28 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000552544 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30600  SAF domain-containing protein  38.35 
 
 		 261 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0434873  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4090  SAF domain protein  40.57 
 
 		 218 aa  45.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0625  SAF domain protein  33.87 
 
 		 191 aa  45.4  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0901  SAF domain protein  33.86 
 
 		 207 aa  45.1  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1279  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>