16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1753 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1753  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  448  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.700752 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1817  SAF domain protein  33.65 
 
 
241 aa  90.5  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.727972  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1257  SAF domain protein  37.56 
 
 
219 aa  89.4  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.209617  normal  0.160652 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1374  SAF domain protein  34.68 
 
 
214 aa  87.8  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109733  normal  0.485812 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20550  SAF domain-containing protein  32.16 
 
 
213 aa  79  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1214  putative signal peptide  36.27 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19129  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2432  hypothetical protein  28.74 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2320  hypothetical protein  33.81 
 
 
221 aa  68.6  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.857731  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4272  SAF domain protein  42.86 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.575112  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3802  hypothetical protein  34.95 
 
 
234 aa  63.5  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.046949  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14650  SAF domain-containing protein  32.8 
 
 
215 aa  62.8  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2500  hypothetical protein  38.19 
 
 
216 aa  57.4  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2701  hypothetical protein  27.84 
 
 
214 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.36499  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08710  SAF domain-containing protein  40.38 
 
 
219 aa  45.4  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.743101 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2867  hypothetical protein  30.67 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20640  Flp pilus assembly protein CpaB  33.71 
 
 
273 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>