13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1817 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1817  SAF domain protein  100 
 
 
241 aa  471  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.727972  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2320  hypothetical protein  37.98 
 
 
221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.857731  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2500  hypothetical protein  40.78 
 
 
216 aa  95.5  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2432  hypothetical protein  30.48 
 
 
213 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1257  SAF domain protein  32.52 
 
 
219 aa  90.1  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.209617  normal  0.160652 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20550  SAF domain-containing protein  30.88 
 
 
213 aa  90.1  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1753  hypothetical protein  33.65 
 
 
236 aa  82.4  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.700752 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14650  SAF domain-containing protein  30.99 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1374  SAF domain protein  32.26 
 
 
214 aa  63.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109733  normal  0.485812 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2701  hypothetical protein  29.27 
 
 
214 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.36499  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3802  hypothetical protein  28.85 
 
 
234 aa  61.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.046949  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08710  SAF domain-containing protein  31.53 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.743101 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1214  putative signal peptide  29.11 
 
 
224 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>