14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2320 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2320  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.857731  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2500  hypothetical protein  48.86 
 
 
216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1257  SAF domain protein  43.54 
 
 
219 aa  135  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.209617  normal  0.160652 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1817  SAF domain protein  37.98 
 
 
241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.727972  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2432  hypothetical protein  36.67 
 
 
213 aa  122  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20550  SAF domain-containing protein  36.02 
 
 
213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14650  SAF domain-containing protein  39.32 
 
 
215 aa  105  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2701  hypothetical protein  33.01 
 
 
214 aa  88.6  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.36499  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1214  putative signal peptide  37.75 
 
 
224 aa  79  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19129  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3802  hypothetical protein  35.85 
 
 
234 aa  73.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.046949  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08710  SAF domain-containing protein  36.57 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.743101 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1374  SAF domain protein  32.47 
 
 
214 aa  72  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109733  normal  0.485812 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1753  hypothetical protein  34.91 
 
 
236 aa  64.3  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.700752 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4272  SAF domain protein  41.98 
 
 
317 aa  51.6  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.575112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>