15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_08710 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_08710  SAF domain-containing protein  100 
 
 		 219 aa  413  1e-114  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.743101 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2320  hypothetical protein  36.57 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.857731  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1257  SAF domain protein  36.73 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.209617  normal  0.160652 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20550  SAF domain-containing protein  32.38 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2500  hypothetical protein  37.91 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1817  SAF domain protein  31.53 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.727972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2432  hypothetical protein  30.2 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14650  SAF domain-containing protein  34.15 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2701  hypothetical protein  30.88 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.36499  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1374  SAF domain protein  34.62 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109733  normal  0.485812 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1753  hypothetical protein  40.38 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.700752 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5833  SAF domain-containing protein  34.43 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1221  SAF domain protein  39.8 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00137916 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0772  hypothetical protein  35.66 
 
 		 257 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1214  putative signal peptide  35.71 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>