15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0772 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0772  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  499  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5833  SAF domain-containing protein  70.54 
 
 		 258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1374  SAF domain protein  37.5 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109733  normal  0.485812 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08710  SAF domain-containing protein  34.72 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.743101 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1214  putative signal peptide  39.87 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19129  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1753  hypothetical protein  32.13 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.700752 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20550  SAF domain-containing protein  30.81 
 
 		 213 aa  61.6  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2320  hypothetical protein  31.84 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.857731  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1257  SAF domain protein  35.57 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.209617  normal  0.160652 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1221  SAF domain protein  32.58 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00137916 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4272  SAF domain protein  43.54 
 
 		 317 aa  47  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.575112  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2764  SAF domain protein  30.26 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0134302  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14650  SAF domain-containing protein  39.71 
 
 		 215 aa  44.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2432  hypothetical protein  35.9 
 
 		 213 aa  43.9  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1817  SAF domain protein  27.81 
 
 		 241 aa  43.5  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.727972  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>