13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_20550 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_20550  SAF domain-containing protein  100 
 
 		 213 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2432  hypothetical protein  35.92 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2320  hypothetical protein  36.02 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.857731  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1257  SAF domain protein  36.27 
 
 		 219 aa  101  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.209617  normal  0.160652 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2701  hypothetical protein  34.47 
 
 		 214 aa  94  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.36499  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2500  hypothetical protein  40.89 
 
 		 216 aa  92.8  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1817  SAF domain protein  30.88 
 
 		 241 aa  90.1  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.727972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1374  SAF domain protein  31.07 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109733  normal  0.485812 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1753  hypothetical protein  36.52 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.700752 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14650  SAF domain-containing protein  29.58 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3802  hypothetical protein  36.89 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.046949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1214  putative signal peptide  34.41 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19129  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08710  SAF domain-containing protein  32.38 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.743101 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>