14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1257 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1257  SAF domain protein  100 
 
 		 219 aa  413  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.209617  normal  0.160652 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2320  hypothetical protein  43.54 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.857731  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2432  hypothetical protein  35.12 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20550  SAF domain-containing protein  36.27 
 
 		 213 aa  101  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2701  hypothetical protein  36.54 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.36499  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1817  SAF domain protein  32.52 
 
 		 241 aa  90.1  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.727972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2500  hypothetical protein  49.29 
 
 		 216 aa  88.6  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1214  putative signal peptide  45.65 
 
 		 224 aa  85.1  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19129  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1753  hypothetical protein  37.56 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.700752 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14650  SAF domain-containing protein  35.87 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3802  hypothetical protein  36.27 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.046949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1374  SAF domain protein  30.85 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109733  normal  0.485812 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08710  SAF domain-containing protein  36.73 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.743101 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4272  SAF domain protein  42.86 
 
 		 317 aa  45.4  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.575112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>