16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3802 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3802  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  428  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.046949  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2432  hypothetical protein  35.27 
 
 
213 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2320  hypothetical protein  36.45 
 
 
221 aa  97.4  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.857731  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1257  SAF domain protein  36.59 
 
 
219 aa  94  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.209617  normal  0.160652 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2701  hypothetical protein  34.91 
 
 
214 aa  92.4  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.36499  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20550  SAF domain-containing protein  36.06 
 
 
213 aa  92  7e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1214  putative signal peptide  46 
 
 
224 aa  90.5  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19129  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1374  SAF domain protein  35.68 
 
 
214 aa  86.3  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109733  normal  0.485812 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14650  SAF domain-containing protein  40.1 
 
 
215 aa  84  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2500  hypothetical protein  42.52 
 
 
216 aa  82  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1817  SAF domain protein  28.85 
 
 
241 aa  77.8  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.727972  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1753  hypothetical protein  33.8 
 
 
236 aa  75.9  0.0000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.700752 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4272  SAF domain protein  42.76 
 
 
317 aa  49.3  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.575112  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08710  SAF domain-containing protein  31 
 
 
219 aa  47.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.743101 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4642  SAF domain-containing protein  35.54 
 
 
252 aa  47  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4731  SAF domain-containing protein  28.34 
 
 
259 aa  42.7  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129997  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>