19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4642 on replicon NC_009806
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009806  Krad_4642  SAF domain-containing protein  100 
 
 		 252 aa  492  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1539  SAF domain-containing protein  33.78 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1738  hypothetical protein  35.14 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00359989  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8600  SAF domain protein  36.28 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  0.418503 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4731  SAF domain-containing protein  27.97 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0669  SAF domain protein  32.84 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2596  SAF domain-containing protein  35.14 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.936822  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1221  SAF domain protein  33.06 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00137916 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4144  hypothetical protein  34.68 
 
 		 297 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.810399  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3136  SAF domain protein  31.62 
 
 		 241 aa  53.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000294496  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3417  SAF domain protein  29.57 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2764  SAF domain protein  29.2 
 
 		 224 aa  49.3  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0134302  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1358  SAF domain-containing protein  34.3 
 
 		 221 aa  48.5  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4459  SAF domain-containing protein  30.99 
 
 		 219 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.904172  normal  0.113707 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2220  SAF domain-containing protein  32.65 
 
 		 224 aa  45.4  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0844  SAF domain protein  30.99 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332054  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3802  hypothetical protein  35.03 
 
 		 234 aa  43.5  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.046949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4972  SAF domain-containing protein  29.63 
 
 		 219 aa  43.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4390  Flp pilus assembly CpaB  37.31 
 
 		 319 aa  42  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.752776  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>