15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1539 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1539  SAF domain-containing protein  100 
 
 		 230 aa  442  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4731  SAF domain-containing protein  38.6 
 
 		 259 aa  136  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4642  SAF domain-containing protein  34.38 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3417  SAF domain protein  31.74 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2764  SAF domain protein  33.12 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0134302  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8600  SAF domain protein  38.79 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  0.418503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4459  SAF domain-containing protein  32.84 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.904172  normal  0.113707 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1738  hypothetical protein  37.86 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00359989  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4972  SAF domain-containing protein  31.86 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0844  SAF domain protein  31.07 
 
 		 218 aa  53.5  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1304  hypothetical protein  31.98 
 
 		 242 aa  52  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.412124  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1221  SAF domain protein  29.08 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00137916 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2220  SAF domain-containing protein  35.93 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0669  SAF domain protein  31.01 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2596  SAF domain-containing protein  34.95 
 
 		 229 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.936822  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>