14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1304 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1304  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.412124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4144  hypothetical protein  50.79 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.810399  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3136  SAF domain protein  34.03 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000294496  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4642  SAF domain-containing protein  34.85 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2764  SAF domain protein  32.73 
 
 		 224 aa  52.4  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0134302  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8201  hypothetical protein  36.08 
 
 		 229 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1539  SAF domain-containing protein  30.28 
 
 		 230 aa  52  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8600  SAF domain protein  31.82 
 
 		 197 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  0.418503 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4731  SAF domain-containing protein  25.93 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3417  SAF domain protein  26.4 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1738  hypothetical protein  32.04 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00359989  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2596  SAF domain-containing protein  33.01 
 
 		 229 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.936822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1358  SAF domain-containing protein  34.62 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4972  SAF domain-containing protein  30.56 
 
 		 219 aa  42.4  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>