13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4144 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4144  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  559  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.810399  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1304  hypothetical protein  47.22 
 
 
242 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.412124  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4642  SAF domain-containing protein  34.02 
 
 
252 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3417  SAF domain protein  31.48 
 
 
234 aa  63.2  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8201  hypothetical protein  36.97 
 
 
229 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2764  SAF domain protein  32.5 
 
 
224 aa  59.3  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0134302  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3136  SAF domain protein  32.14 
 
 
241 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000294496  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8600  SAF domain protein  35.11 
 
 
197 aa  52.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  0.418503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4459  SAF domain-containing protein  31.68 
 
 
219 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.904172  normal  0.113707 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4972  SAF domain-containing protein  32.37 
 
 
219 aa  47.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0669  SAF domain protein  30.85 
 
 
229 aa  47.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2596  SAF domain-containing protein  31 
 
 
229 aa  43.5  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.936822  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1738  hypothetical protein  32 
 
 
230 aa  43.1  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00359989  normal  0.140978 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>