26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2764 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2764  SAF domain protein  100 
 
 		 224 aa  431  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0134302  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3136  SAF domain protein  36.11 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000294496  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3417  SAF domain protein  29.51 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4731  SAF domain-containing protein  27.75 
 
 		 259 aa  65.1  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4144  hypothetical protein  33.12 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.810399  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1539  SAF domain-containing protein  33.71 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4642  SAF domain-containing protein  33.33 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4972  SAF domain-containing protein  29.85 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2220  SAF domain-containing protein  33.04 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0844  SAF domain protein  27.01 
 
 		 218 aa  52.8  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332054  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2596  SAF domain-containing protein  33.04 
 
 		 229 aa  52  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.936822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4459  SAF domain-containing protein  30.34 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.904172  normal  0.113707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1304  hypothetical protein  32.2 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.412124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0669  SAF domain protein  33.59 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1738  hypothetical protein  31.58 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00359989  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1358  SAF domain-containing protein  34.92 
 
 		 221 aa  48.5  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1221  SAF domain protein  29.73 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00137916 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8600  SAF domain protein  33.83 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  0.418503 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3333  hypothetical protein  33.77 
 
 		 246 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0265719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1735  SAF domain protein  31.45 
 
 		 265 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.822432 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1274  SAF domain protein  36.03 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0833437  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20550  SAF domain-containing protein  32.14 
 
 		 213 aa  43.5  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1257  SAF domain protein  28 
 
 		 219 aa  42.4  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.209617  normal  0.160652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4029  SAF domain protein  33.75 
 
 		 230 aa  42  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177398  hitchhiker  0.00623297 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0772  hypothetical protein  28.28 
 
 		 257 aa  42  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1374  SAF domain protein  31.12 
 
 		 214 aa  41.6  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109733  normal  0.485812 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>