17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8600 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8600  SAF domain protein  100 
 
 		 197 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  0.418503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4029  SAF domain protein  41.32 
 
 		 230 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177398  hitchhiker  0.00623297 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2596  SAF domain-containing protein  42.14 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.936822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6896  SAF domain protein  39.75 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000834652  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1738  hypothetical protein  40.88 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00359989  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1221  SAF domain protein  31.25 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00137916 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3417  SAF domain protein  34.88 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4642  SAF domain-containing protein  35.22 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1539  SAF domain-containing protein  36.21 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4459  SAF domain-containing protein  37.17 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.904172  normal  0.113707 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4972  SAF domain-containing protein  37.17 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1304  hypothetical protein  33.99 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.412124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0669  SAF domain protein  32.57 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4144  hypothetical protein  31.49 
 
 		 297 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.810399  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2764  SAF domain protein  32.43 
 
 		 224 aa  48.1  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0134302  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2220  SAF domain-containing protein  34.31 
 
 		 224 aa  45.4  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4731  SAF domain-containing protein  30.99 
 
 		 259 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129997  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>