16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4029 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4029  SAF domain protein  100 
 
 		 230 aa  430  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177398  hitchhiker  0.00623297 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8600  SAF domain protein  40.22 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  0.418503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6896  SAF domain protein  37.5 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000834652  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2596  SAF domain-containing protein  36.84 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.936822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0669  SAF domain protein  37.95 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1738  hypothetical protein  36.26 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00359989  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4459  SAF domain-containing protein  37.06 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.904172  normal  0.113707 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4972  SAF domain-containing protein  40.35 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4731  SAF domain-containing protein  31.58 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129997  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1221  SAF domain protein  29.2 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00137916 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3417  SAF domain protein  32.37 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2220  SAF domain-containing protein  32.71 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2764  SAF domain protein  36.28 
 
 		 224 aa  47  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0134302  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4144  hypothetical protein  34.42 
 
 		 297 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.810399  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4642  SAF domain-containing protein  31.4 
 
 		 252 aa  46.6  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0844  SAF domain protein  31.87 
 
 		 218 aa  41.6  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>