19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1738 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1738  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  423  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00359989  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2596  SAF domain-containing protein  89.04 
 
 		 229 aa  330  8e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.936822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4029  SAF domain protein  35.96 
 
 		 230 aa  89  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177398  hitchhiker  0.00623297 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8600  SAF domain protein  36.41 
 
 		 197 aa  85.9  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  0.418503 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1221  SAF domain protein  37.66 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00137916 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4642  SAF domain-containing protein  33.12 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4731  SAF domain-containing protein  31.95 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6896  SAF domain protein  39.34 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000834652  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0669  SAF domain protein  35.78 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4459  SAF domain-containing protein  34.22 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.904172  normal  0.113707 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3136  SAF domain protein  33.33 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000294496  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1539  SAF domain-containing protein  31.82 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2764  SAF domain protein  31.58 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0134302  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4972  SAF domain-containing protein  33.81 
 
 		 219 aa  48.9  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1304  hypothetical protein  32.04 
 
 		 242 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.412124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4144  hypothetical protein  29.81 
 
 		 297 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.810399  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3417  SAF domain protein  24.63 
 
 		 234 aa  43.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1358  SAF domain-containing protein  31.4 
 
 		 221 aa  42.4  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2220  SAF domain-containing protein  34.23 
 
 		 224 aa  42  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>