10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6896 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6896  SAF domain protein  100 
 
 		 222 aa  418  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000834652  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8600  SAF domain protein  38.83 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  0.418503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2596  SAF domain-containing protein  44.53 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.936822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4029  SAF domain protein  41.24 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177398  hitchhiker  0.00623297 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1738  hypothetical protein  41.35 
 
 		 230 aa  72  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00359989  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4642  SAF domain-containing protein  28.44 
 
 		 252 aa  53.1  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4731  SAF domain-containing protein  27 
 
 		 259 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2764  SAF domain protein  34.5 
 
 		 224 aa  48.5  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0134302  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1221  SAF domain protein  29.19 
 
 		 223 aa  45.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00137916 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1539  SAF domain-containing protein  29.51 
 
 		 230 aa  42  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>