19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2596 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2596  SAF domain-containing protein  100 
 
 		 229 aa  418  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.936822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1738  hypothetical protein  89.04 
 
 		 230 aa  308  5e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00359989  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4029  SAF domain protein  35.68 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177398  hitchhiker  0.00623297 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8600  SAF domain protein  43.31 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  0.418503 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1221  SAF domain protein  32.84 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00137916 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4642  SAF domain-containing protein  32.3 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6896  SAF domain protein  41.8 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000834652  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4459  SAF domain-containing protein  34.78 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.904172  normal  0.113707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0669  SAF domain protein  35.29 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3136  SAF domain protein  34.72 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000294496  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4731  SAF domain-containing protein  29.06 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2764  SAF domain protein  33.04 
 
 		 224 aa  52.4  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0134302  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4972  SAF domain-containing protein  35.77 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2220  SAF domain-containing protein  34.19 
 
 		 224 aa  45.4  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1304  hypothetical protein  33.01 
 
 		 242 aa  45.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.412124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0844  SAF domain protein  33.33 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332054  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3333  hypothetical protein  38.24 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0265719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1539  SAF domain-containing protein  30.57 
 
 		 230 aa  42.7  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4144  hypothetical protein  30.56 
 
 		 297 aa  42  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.810399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>