15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4459 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4459  SAF domain-containing protein  100 
 
 		 219 aa  418  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.904172  normal  0.113707 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4972  SAF domain-containing protein  89.5 
 
 		 219 aa  357  9e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0669  SAF domain protein  37.91 
 
 		 229 aa  89  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3417  SAF domain protein  37.43 
 
 		 234 aa  88.2  9e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2220  SAF domain-containing protein  37.5 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4029  SAF domain protein  37.06 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177398  hitchhiker  0.00623297 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0844  SAF domain protein  37.32 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332054  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8600  SAF domain protein  37.17 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  0.418503 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1539  SAF domain-containing protein  33.33 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1738  hypothetical protein  36 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00359989  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4642  SAF domain-containing protein  30.99 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2596  SAF domain-containing protein  34.04 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.936822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2764  SAF domain protein  34.41 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0134302  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8201  hypothetical protein  28.46 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6896  SAF domain protein  44.83 
 
 		 222 aa  41.6  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000834652  normal  0.411679 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>