16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3417 on replicon NC_013531
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013531  Xcel_3417  SAF domain protein  100 
 
 
234 aa  451  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2220  SAF domain-containing protein  48.31 
 
 
224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0844  SAF domain protein  36.87 
 
 
218 aa  102  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332054  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4459  SAF domain-containing protein  36.95 
 
 
219 aa  97.1  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.904172  normal  0.113707 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4972  SAF domain-containing protein  34.83 
 
 
219 aa  92  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0669  SAF domain protein  34.89 
 
 
229 aa  78.6  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1539  SAF domain-containing protein  31.44 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2764  SAF domain protein  30.37 
 
 
224 aa  65.1  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0134302  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1358  SAF domain-containing protein  35.77 
 
 
221 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8600  SAF domain protein  32.4 
 
 
197 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  0.418503 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4144  hypothetical protein  31.05 
 
 
297 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.810399  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4642  SAF domain-containing protein  29.57 
 
 
252 aa  52.8  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4731  SAF domain-containing protein  26.54 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129997  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3333  hypothetical protein  27.75 
 
 
246 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0265719  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3136  SAF domain protein  32.41 
 
 
241 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000294496  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1221  SAF domain protein  28.48 
 
 
223 aa  42  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00137916 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>