14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4731 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4731  SAF domain-containing protein  100 
 
 		 259 aa  502  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1539  SAF domain-containing protein  38.6 
 
 		 230 aa  125  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2764  SAF domain protein  30.18 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0134302  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1738  hypothetical protein  32.77 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00359989  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4642  SAF domain-containing protein  28.78 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1221  SAF domain protein  25.49 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00137916 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0669  SAF domain protein  29.69 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2596  SAF domain-containing protein  32.73 
 
 		 229 aa  48.9  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.936822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2220  SAF domain-containing protein  32.08 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3417  SAF domain protein  26.54 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4029  SAF domain protein  32.58 
 
 		 230 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177398  hitchhiker  0.00623297 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0844  SAF domain protein  27.47 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332054  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4972  SAF domain-containing protein  29.75 
 
 		 219 aa  42.7  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  28 
 
 		 263 aa  42  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>