121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3352 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3352  peptidase M61 domain protein  100 
 
 
598 aa  1241    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.430349 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2360  peptidase M61 domain-containing protein  30.3 
 
 
617 aa  286  1.0000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300875  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1559  peptidase M61 domain protein  27 
 
 
621 aa  253  5.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0391079  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07485  hypothetical protein  28.23 
 
 
626 aa  251  3e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0867062  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1394  PDZ/DHR/GLGF  27.15 
 
 
587 aa  182  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.54966  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3297  peptidase M61 domain protein  25.65 
 
 
601 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal  0.542391 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2803  peptidase M61 domain protein  25.65 
 
 
601 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2705  peptidase M61 domain-containing protein  23.14 
 
 
597 aa  160  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754502  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1038  peptidase M61  23.6 
 
 
600 aa  159  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3734  peptidase M61 domain protein  23.15 
 
 
596 aa  153  7e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.393831  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2578  peptidase M61  23.57 
 
 
599 aa  153  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0527  peptidase M61 domain-containing protein  23.57 
 
 
599 aa  153  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0145  peptidase M61  24.91 
 
 
594 aa  152  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3614  peptidase M61  22.93 
 
 
599 aa  151  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1433  peptidase M61 domain protein  24.22 
 
 
591 aa  150  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2867  peptidase M61 domain-containing protein  23.1 
 
 
600 aa  150  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  0.558935 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2916  PDZ domain-containing protein  23.03 
 
 
590 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0432  peptidase M61 domain-containing protein  22.96 
 
 
622 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0456  peptidase M61 domain-containing protein  22.59 
 
 
599 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0474083 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1217  peptidase M61  22.93 
 
 
601 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0353821  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3590  PDZ domain-containing protein  23.04 
 
 
609 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0499  peptidase M61 domain-containing protein  23.06 
 
 
599 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4827  peptidase M61 domain-containing protein  24.64 
 
 
585 aa  148  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3563  PDZ domain-containing protein  23.04 
 
 
609 aa  147  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3503  peptidase M61 domain protein  22.81 
 
 
596 aa  147  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.835737  hitchhiker  0.00306179 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0454  metalloprotease, zinc binding  22.31 
 
 
596 aa  146  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.573755 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0526  PDZ domain-containing protein  22.87 
 
 
609 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3582  peptidase  22.76 
 
 
612 aa  146  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.955515  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0651  PDZ domain-containing protein  22.87 
 
 
609 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0947  PDZ domain-containing protein  22.87 
 
 
609 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1917  PDZ domain-containing protein  22.87 
 
 
609 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3762  peptidase M61 domain-containing protein  23.67 
 
 
594 aa  142  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0112026  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2772  peptidase M61 domain-containing protein  24.48 
 
 
608 aa  140  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.919239  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4799  peptidase M61 domain protein  23.76 
 
 
590 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2301  peptidase M61 domain protein  22.52 
 
 
615 aa  138  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.9294  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3323  peptidase M61 domain protein  22.81 
 
 
689 aa  138  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0788147  decreased coverage  0.00902527 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0306  peptidase M61 domain protein  23.08 
 
 
602 aa  138  4e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2619  peptidase M61  23.86 
 
 
614 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.84974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2037  peptidase M61 domain protein  23.65 
 
 
618 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129512 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2712  peptidase M61 domain-containing protein  25.08 
 
 
603 aa  134  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00529287  hitchhiker  0.00000288485 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3184  peptidase M61 domain-containing protein  23.62 
 
 
601 aa  133  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.152326 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2326  peptidase M61  22.86 
 
 
591 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3033  PDZ/DHR/GLGF:peptidase M61  22.02 
 
 
612 aa  130  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2972  peptidase M61 domain-containing protein  24.71 
 
 
601 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0085127  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2780  peptidase M61 domain-containing protein  24.43 
 
 
603 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.226266  hitchhiker  0.00190153 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1653  peptidase M61 domain-containing protein  24.08 
 
 
592 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.283043  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2554  peptidase M61  25 
 
 
616 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000699097  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2752  peptidase M61 domain-containing protein  23.6 
 
 
598 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.733625  hitchhiker  0.000408122 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2984  peptidase M61 domain protein  22.91 
 
 
605 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.536763  hitchhiker  0.000251259 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3534  M61 family peptidase  22.78 
 
 
610 aa  127  5e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1361  peptidase M61 domain-containing protein  23.58 
 
 
605 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.223478  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3082  peptidase M61 domain-containing protein  23.79 
 
 
600 aa  124  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201317  hitchhiker  0.00967911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2882  peptidase M61 domain-containing protein  23.77 
 
 
603 aa  124  7e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0208094  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1447  protease, putative  22.77 
 
 
587 aa  123  9e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.747842  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1375  peptidase M61 domain-containing protein  23.58 
 
 
605 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0830083  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1293  peptidase M61 domain-containing protein  22.98 
 
 
603 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00192271  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1400  peptidase M61 domain-containing protein  23.4 
 
 
605 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0529885  decreased coverage  0.00282724 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3307  peptidase M61 domain-containing protein  23.9 
 
 
598 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0838775  hitchhiker  0.0000441235 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0309  peptidase M61 domain protein  21.92 
 
 
585 aa  120  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.829558  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2489  peptidase M61 domain protein  23.27 
 
 
588 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1789  peptidase M61 domain-containing protein  23.27 
 
 
588 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.119703  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1493  peptidase M61  21.51 
 
 
604 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333369  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3188  peptidase M61  21.58 
 
 
604 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3456  peptidase M61 domain-containing protein  21.89 
 
 
601 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.243509  decreased coverage  0.0000586563 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1797  peptidase M61 domain-containing protein  22.91 
 
 
588 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2385  peptidase M61 domain-containing protein  22.68 
 
 
588 aa  115  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2508  peptidase M61 domain-containing protein  22.68 
 
 
588 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000376919 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1833  peptidase M61 domain-containing protein  22.67 
 
 
588 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.180566  normal  0.794619 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2315  peptidase M61 domain-containing protein  22.68 
 
 
588 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.261974  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3622  peptidase M61 domain-containing protein  23.1 
 
 
593 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2416  peptidase M61  21.75 
 
 
624 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.353738  normal  0.453663 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1521  peptidase M61 domain-containing protein  21.78 
 
 
585 aa  112  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2932  peptidase M61 domain protein  22.92 
 
 
593 aa  111  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.500697  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0594  peptidase  23.71 
 
 
571 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.154307  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2389  peptidase M61  22.24 
 
 
616 aa  111  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2724  protease, putative  22.72 
 
 
588 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2890  hypothetical protein  20.68 
 
 
621 aa  108  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.633242  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3346  peptidase M61 domain-containing protein  23.55 
 
 
585 aa  107  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1386  PDZ/DHR/GLGF  22.26 
 
 
545 aa  107  8e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4645  peptidase M61 domain protein  21.75 
 
 
618 aa  106  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1123  peptidase M61  22.04 
 
 
613 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01914  protease, putative  20.25 
 
 
602 aa  102  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0353072  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3407  peptidase M61 domain protein  24.93 
 
 
584 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1530  peptidase M61 domain-containing protein  21.82 
 
 
641 aa  102  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.265264 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3288  peptidase M61  24.79 
 
 
585 aa  101  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2766  peptidase M61 domain protein  20.29 
 
 
623 aa  101  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.612907 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0264  peptidase M61 domain-containing protein  21.73 
 
 
578 aa  100  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.023247 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1797  peptidase M61 domain protein  21.77 
 
 
607 aa  99.4  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2138  PDZ domain protein  21.77 
 
 
617 aa  99.4  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3132  peptidase M61 domain protein  20.79 
 
 
623 aa  98.6  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.831871 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3363  peptidase M61 domain protein  25.15 
 
 
584 aa  98.6  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0462  peptidase M61 domain-containing protein  22.22 
 
 
592 aa  97.8  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1882  peptidase M61  21.49 
 
 
584 aa  94.7  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.347661  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0139  peptidase M61 domain-containing protein  20.96 
 
 
594 aa  94.7  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.554746  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0883  peptidase M61 domain-containing protein  22.55 
 
 
597 aa  93.2  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374463  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0152  peptidase M61 domain protein  20.34 
 
 
593 aa  91.7  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.125794 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1205  peptidase M61 domain protein  20.78 
 
 
606 aa  91.3  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.440173 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1102  PDZ/DHR/GLGF  20.68 
 
 
565 aa  89.4  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0587047  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4157  peptidase M61 domain protein  20.48 
 
 
497 aa  88.6  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1574  peptidase M61  22.18 
 
 
608 aa  80.9  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>