147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1182 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1182  Citrate transporter  100 
 
 		 431 aa  858    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1848  Citrate transporter  64.32 
 
 		 429 aa  567  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2788  citrate transporter  52.82 
 
 		 428 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2143  putative Na+/H+ antiporter  52.11 
 
 		 427 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000114248  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2206  putative Na+/H+ antiporter  50.7 
 
 		 427 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.584223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0683  Na+/H+ antiporter  55.35 
 
 		 427 aa  434  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.685897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1052  citrate transporter  49.65 
 
 		 426 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3532  citrate transporter  48.37 
 
 		 458 aa  424  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2955  hypothetical protein  49.42 
 
 		 427 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.18478 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06635  probable Na+/H+ antiporter  47.3 
 
 		 456 aa  410  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.962543  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1484  Citrate transporter  46.94 
 
 		 441 aa  384  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_42116  predicted protein  44.06 
 
 		 417 aa  354  2e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0247  Na+/H+ antiporter, putative  42.14 
 
 		 427 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.180636  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1556  hypothetical protein  31.29 
 
 		 462 aa  188  2e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.737532  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0500  Na+/H+ antiporter  31.31 
 
 		 452 aa  186  9e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0939  NeuB3  30.91 
 
 		 462 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3245  Na+/H+ antiporter  32.14 
 
 		 489 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.486391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0778  Na+/H+ antiporter  31.84 
 
 		 489 aa  180  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.827414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0421  transporter, putative  31.9 
 
 		 457 aa  179  5.999999999999999e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3512  Na+/H+ antiporter NhaD  30.73 
 
 		 448 aa  179  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2676  transporter, putative  31.67 
 
 		 450 aa  179  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.168345  normal  0.0363345 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3348  Na+/H+ antiporter  30.97 
 
 		 489 aa  176  6e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017498  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0935  Na+/H+ antiporter  30.75 
 
 		 476 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0877  Na+/H+ antiporter  31.18 
 
 		 478 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.654958  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000950  Na+/H+ antiporter NhaD type  29.98 
 
 		 476 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0998  Na+/H+ antiporter, NhaD  31.7 
 
 		 432 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.596144  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0832  citrate transporter  30.68 
 
 		 489 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.726453  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2658  citrate transporter  31.78 
 
 		 432 aa  173  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3460  Citrate transporter  30.68 
 
 		 489 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3535  citrate transporter  30.68 
 
 		 489 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0065  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  29.66 
 
 		 467 aa  172  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.249697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3654  citrate transporter  30.55 
 
 		 489 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0594  Citrate transporter  31.74 
 
 		 449 aa  171  3e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0225  Na+/H+ antiporter  32.44 
 
 		 477 aa  171  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0111  NhaD-like Na+/H+ antiporter  30.49 
 
 		 460 aa  168  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000313583  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1492  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  29.27 
 
 		 488 aa  167  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389084  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0699  Na+/H+ antiporter  29.84 
 
 		 491 aa  166  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2058  transporter, putative  28.47 
 
 		 470 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.509671  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0474  citrate transporter  30.26 
 
 		 480 aa  164  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.331681  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3272  citrate transporter  28.64 
 
 		 475 aa  162  9e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1762  transporter, putative  28.41 
 
 		 481 aa  161  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06992  hypothetical protein  28.86 
 
 		 476 aa  161  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2753  Na+/H+ antiporter  30 
 
 		 490 aa  159  9e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.709731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0679  Na+/H+ antiporter  30.43 
 
 		 492 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0694  citrate transporter  28.29 
 
 		 475 aa  156  7e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0447  citrate transporter  30.69 
 
 		 490 aa  151  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000299254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2571  endonuclease III/Nth  30.53 
 
 		 401 aa  147  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2792  putative Na+/H+ antiporter NhaD  31.7 
 
 		 414 aa  140  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3442  Na+/H+ antiporter NhaD  29.81 
 
 		 465 aa  136  6.0000000000000005e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2735  transporter, putative  27.6 
 
 		 493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482614  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2894  citrate transporter  30.86 
 
 		 436 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2976  citrate transporter  30.23 
 
 		 436 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0156063 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3073  citrate transporter  30.63 
 
 		 436 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.282426  hitchhiker  0.00000161736 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1011  citrate transporter  28.95 
 
 		 415 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000075271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1118  citrate transporter  28.57 
 
 		 415 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3155  Citrate transporter  28.57 
 
 		 415 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.835632  normal  0.747102 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2820  citrate transporter  28.09 
 
 		 415 aa  125  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000152112  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1158  citrate transporter  28.57 
 
 		 415 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1235  citrate transporter  28.57 
 
 		 415 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0598103  normal  0.863417 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1202  citrate transporter  28.57 
 
 		 415 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549096  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1169  citrate transporter  28.99 
 
 		 415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  decreased coverage  0.00000098919 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0837  citrate transporter  28.78 
 
 		 415 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1087  citrate transporter  28.37 
 
 		 415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953258 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2981  citrate transporter  28.74 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1425  citrate transporter  29.66 
 
 		 417 aa  113  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.627644  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1700  transporter, putative  26.3 
 
 		 483 aa  106  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2740  citrate transporter  26.25 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.344537 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  27.23 
 
 		 429 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  26.9 
 
 		 429 aa  79.7  0.00000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3404  hypothetical protein  26.61 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  26.89 
 
 		 426 aa  75.5  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  24.94 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0939  hypothetical protein  27.36 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  25.4 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  26 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  26.34 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0573  arsenite permease  24.73 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.77742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  25.06 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  24.7 
 
 		 577 aa  65.1  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  26.42 
 
 		 440 aa  64.3  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  25.32 
 
 		 431 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  23.96 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  27.71 
 
 		 424 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1298.4  Na(+)/H(+) antiporter  29.81 
 
 		 194 aa  62  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  23.63 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  25 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  28.44 
 
 		 431 aa  60.1  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  23.81 
 
 		 447 aa  60.1  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  22.6 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  25.67 
 
 		 440 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  26.16 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  25.42 
 
 		 465 aa  57  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  24 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  24.14 
 
 		 422 aa  55.1  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  21.89 
 
 		 425 aa  54.7  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  25.08 
 
 		 428 aa  54.3  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  24.74 
 
 		 427 aa  53.9  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  23.58 
 
 		 424 aa  53.5  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5880  citrate transporter  24.29 
 
 		 446 aa  53.9  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  24.52 
 
 		 441 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>