More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1338 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  100 
 
 		 577 aa  1153    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  44.24 
 
 		 427 aa  318  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  40.64 
 
 		 423 aa  311  2e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  42.73 
 
 		 427 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  41.71 
 
 		 423 aa  303  5.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  40.7 
 
 		 419 aa  299  9e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  40.98 
 
 		 431 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  44.47 
 
 		 424 aa  288  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  40.98 
 
 		 440 aa  288  2e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  39.72 
 
 		 421 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  41.4 
 
 		 426 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  39.59 
 
 		 427 aa  280  3e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  40.77 
 
 		 427 aa  280  7e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  38.26 
 
 		 424 aa  278  2e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  39.59 
 
 		 422 aa  278  2e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  40.32 
 
 		 431 aa  276  6e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  40.41 
 
 		 437 aa  276  6e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44788  predicted protein  39.09 
 
 		 967 aa  275  2.0000000000000002e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  38.74 
 
 		 441 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  38.74 
 
 		 441 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  40.82 
 
 		 437 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  40.82 
 
 		 437 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  41.27 
 
 		 424 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  38.96 
 
 		 441 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4621  arsenical pump membrane protein  38.32 
 
 		 444 aa  270  7e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4643  arsenical pump membrane protein  38.32 
 
 		 444 aa  270  7e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  38.51 
 
 		 441 aa  268  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4781  arsenical pump family protein  38.1 
 
 		 444 aa  269  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5143  arsenical pump family protein  38.1 
 
 		 444 aa  269  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5022  arsenical pump family protein  38.1 
 
 		 441 aa  269  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5050  arsenical pump family protein  37.87 
 
 		 444 aa  267  4e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  38.58 
 
 		 440 aa  267  4e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3522  citrate transporter  37.78 
 
 		 441 aa  267  5e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5043  arsenical pump family protein  37.64 
 
 		 441 aa  267  5e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  38.18 
 
 		 440 aa  265  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  40.05 
 
 		 428 aa  265  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  37.64 
 
 		 444 aa  265  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  39.31 
 
 		 429 aa  264  3e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  38.34 
 
 		 451 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  40.04 
 
 		 451 aa  263  6.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  42.2 
 
 		 431 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  40.09 
 
 		 447 aa  262  1e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  39.22 
 
 		 428 aa  261  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  36.99 
 
 		 425 aa  261  3e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  39.1 
 
 		 441 aa  260  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  39.91 
 
 		 428 aa  259  1e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  38.37 
 
 		 441 aa  257  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  38.37 
 
 		 441 aa  257  4e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  38.24 
 
 		 441 aa  256  9e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  38.24 
 
 		 441 aa  256  9e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  38.24 
 
 		 441 aa  256  9e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  38.24 
 
 		 441 aa  256  9e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  38.51 
 
 		 441 aa  254  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  35 
 
 		 425 aa  249  1e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  39.1 
 
 		 422 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  36.12 
 
 		 415 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  37.89 
 
 		 417 aa  233  6e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  36.49 
 
 		 429 aa  227  5.0000000000000005e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  33.84 
 
 		 408 aa  207  3e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  32.28 
 
 		 429 aa  195  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  34.6 
 
 		 422 aa  195  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1546  citrate transporter  31.34 
 
 		 429 aa  191  2.9999999999999997e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0084311  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1763  citrate transporter  32.86 
 
 		 421 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1699  citrate transporter  30.67 
 
 		 421 aa  170  6e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346911  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1706  citrate transporter  31.04 
 
 		 421 aa  167  4e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0209  arsenical pump membrane protein, putative  31.07 
 
 		 428 aa  162  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.144741  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0796  citrate transporter  32.43 
 
 		 424 aa  159  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1592  citrate transporter  28.21 
 
 		 422 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2811  Citrate transporter  26.86 
 
 		 444 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3289  Citrate transporter  26.86 
 
 		 444 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4948  Citrate transporter  27.27 
 
 		 445 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.837621 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0878  arsenical pump membrane protein  27.72 
 
 		 445 aa  135  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.201371  hitchhiker  0.000139145 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  29.56 
 
 		 419 aa  134  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5261  Citrate transporter  27.06 
 
 		 447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10417  normal  0.132031 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  28.17 
 
 		 400 aa  130  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  27.34 
 
 		 405 aa  124  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  28.5 
 
 		 405 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  27.05 
 
 		 465 aa  118  3e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  25.84 
 
 		 411 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  28.64 
 
 		 408 aa  113  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0353  citrate transporter  26.1 
 
 		 409 aa  112  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0143046  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5880  citrate transporter  25.94 
 
 		 446 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  25.17 
 
 		 402 aa  108  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0041  transport protein  28.41 
 
 		 434 aa  106  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  25.33 
 
 		 414 aa  104  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  26.13 
 
 		 401 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2052  citrate transporter  28.14 
 
 		 447 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  26.3 
 
 		 404 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  25.12 
 
 		 396 aa  100  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  25.18 
 
 		 405 aa  100  8e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.771625 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  27.37 
 
 		 414 aa  99.4  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  26.25 
 
 		 404 aa  99  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  23.85 
 
 		 436 aa  97.4  6e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0791  transporter, putative  26.4 
 
 		 413 aa  95.5  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0000900832  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  24.89 
 
 		 417 aa  94  7e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0573  arsenite permease  27.6 
 
 		 422 aa  90.5  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.77742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0803  citrate transporter  28.43 
 
 		 397 aa  90.1  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1527  anion transporter  25.86 
 
 		 449 aa  89  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.244841  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0714  hypothetical protein  25.77 
 
 		 410 aa  89  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.318283  normal  0.343566 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2656  anion transporter  26.63 
 
 		 414 aa  88.6  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000561885  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>