More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3120 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  100 
 
 
427 aa  838    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  56.94 
 
 
427 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  55.4 
 
 
427 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  55.29 
 
 
424 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  59.33 
 
 
431 aa  441  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  55.94 
 
 
441 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  55.4 
 
 
423 aa  440  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  53.64 
 
 
441 aa  437  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  55.71 
 
 
441 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  54.55 
 
 
441 aa  437  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3522  citrate transporter  56.18 
 
 
441 aa  433  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  53.49 
 
 
423 aa  434  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4781  arsenical pump family protein  55.94 
 
 
444 aa  428  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5022  arsenical pump family protein  55.94 
 
 
441 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5143  arsenical pump family protein  55.94 
 
 
444 aa  428  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  56.18 
 
 
444 aa  428  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5050  arsenical pump family protein  55.94 
 
 
444 aa  427  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4621  arsenical pump membrane protein  55.71 
 
 
444 aa  427  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4643  arsenical pump membrane protein  55.71 
 
 
444 aa  427  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  54.31 
 
 
451 aa  426  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5043  arsenical pump family protein  55.94 
 
 
441 aa  427  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  53.41 
 
 
441 aa  421  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  53.86 
 
 
441 aa  421  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  52.91 
 
 
440 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  53.64 
 
 
441 aa  419  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  53.86 
 
 
441 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  53.86 
 
 
441 aa  419  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  53.86 
 
 
441 aa  419  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  53.86 
 
 
441 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  53.86 
 
 
441 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  54.61 
 
 
424 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  48.69 
 
 
421 aa  394  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  47.79 
 
 
424 aa  381  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  46.39 
 
 
422 aa  380  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  48.32 
 
 
419 aa  377  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  46.08 
 
 
440 aa  365  1e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  44.34 
 
 
427 aa  351  1e-95  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  45.18 
 
 
426 aa  338  8e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  41.61 
 
 
440 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  44.36 
 
 
417 aa  329  6e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  42.03 
 
 
431 aa  321  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  41.41 
 
 
429 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  41.46 
 
 
451 aa  321  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  40.52 
 
 
437 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  40.52 
 
 
437 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  40.75 
 
 
437 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  39.06 
 
 
428 aa  310  2e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  40.23 
 
 
428 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  44.83 
 
 
422 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  40.94 
 
 
415 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  40.23 
 
 
428 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  39.72 
 
 
425 aa  302  7.000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  38.48 
 
 
425 aa  301  2e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  41.8 
 
 
431 aa  295  1e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  40.56 
 
 
577 aa  288  9e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44788  predicted protein  38.84 
 
 
967 aa  284  2.0000000000000002e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  36.88 
 
 
429 aa  260  3e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  39.91 
 
 
447 aa  258  1e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  37.63 
 
 
408 aa  243  6e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1546  citrate transporter  38.94 
 
 
429 aa  239  5e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0084311  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  37.56 
 
 
429 aa  238  2e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  37.96 
 
 
422 aa  237  4e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1763  citrate transporter  33.66 
 
 
421 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1706  citrate transporter  33.17 
 
 
421 aa  186  6e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2811  Citrate transporter  30.95 
 
 
444 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3289  Citrate transporter  30.95 
 
 
444 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1699  citrate transporter  31.41 
 
 
421 aa  177  3e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346911  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0796  citrate transporter  32.94 
 
 
424 aa  177  4e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4948  Citrate transporter  30.62 
 
 
445 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.837621 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5261  Citrate transporter  30.38 
 
 
447 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10417  normal  0.132031 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0878  arsenical pump membrane protein  31.65 
 
 
445 aa  169  9e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.201371  hitchhiker  0.000139145 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1592  citrate transporter  28.02 
 
 
422 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  30.33 
 
 
408 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  27.85 
 
 
405 aa  150  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0209  arsenical pump membrane protein, putative  29.95 
 
 
428 aa  149  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.144741  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  30.83 
 
 
405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  29.14 
 
 
400 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  29.11 
 
 
419 aa  144  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  30.22 
 
 
396 aa  140  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  27.58 
 
 
465 aa  138  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0353  citrate transporter  31.63 
 
 
409 aa  137  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0143046  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  31.91 
 
 
401 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5880  citrate transporter  27.19 
 
 
446 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  27.53 
 
 
411 aa  132  7.999999999999999e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0041  transport protein  31.44 
 
 
434 aa  130  5.0000000000000004e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2052  citrate transporter  26.98 
 
 
447 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0585  Citrate transporter  30.67 
 
 
396 aa  125  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176534 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  26.98 
 
 
414 aa  123  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  25.06 
 
 
414 aa  121  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  24.77 
 
 
405 aa  120  4.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.771625 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  29.11 
 
 
404 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2179  Citrate transporter  29.88 
 
 
429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.365057  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1677  arsenical pump membrane protein  29.68 
 
 
413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2268  Citrate transporter  28.89 
 
 
429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153576  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  28.21 
 
 
436 aa  114  5e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  27.38 
 
 
402 aa  111  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  28.53 
 
 
404 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  26.53 
 
 
417 aa  108  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  26.58 
 
 
426 aa  106  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0573  arsenite permease  26.45 
 
 
422 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.77742  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>