More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_26370 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  100 
 
 
422 aa  830    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  68.79 
 
 
424 aa  595  1e-169  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  58.99 
 
 
427 aa  487  1e-136  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  50.24 
 
 
427 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  47.53 
 
 
441 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  47.24 
 
 
423 aa  384  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  51.21 
 
 
427 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  47.53 
 
 
441 aa  381  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  49.52 
 
 
423 aa  380  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  48.09 
 
 
431 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  46.62 
 
 
419 aa  372  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  47.36 
 
 
424 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  47.76 
 
 
441 aa  365  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  46.79 
 
 
426 aa  367  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  48 
 
 
441 aa  365  1e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  46.39 
 
 
427 aa  363  2e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  47.76 
 
 
441 aa  363  3e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  46.35 
 
 
451 aa  363  4e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  47.53 
 
 
441 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  47.76 
 
 
441 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  47.76 
 
 
441 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  47.76 
 
 
441 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  47.76 
 
 
441 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  45.27 
 
 
440 aa  359  6e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  44.94 
 
 
441 aa  358  7e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  44.13 
 
 
440 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3522  citrate transporter  44.84 
 
 
441 aa  354  2e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  44.24 
 
 
441 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  44.71 
 
 
444 aa  346  4e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5043  arsenical pump family protein  44.24 
 
 
441 aa  346  5e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4621  arsenical pump membrane protein  44.71 
 
 
444 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4643  arsenical pump membrane protein  44.71 
 
 
444 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5022  arsenical pump family protein  44.71 
 
 
441 aa  343  4e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4781  arsenical pump family protein  44.71 
 
 
444 aa  341  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5143  arsenical pump family protein  44.71 
 
 
444 aa  341  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5050  arsenical pump family protein  44.37 
 
 
444 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  41.87 
 
 
421 aa  334  2e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  44.68 
 
 
440 aa  333  3e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  44.76 
 
 
424 aa  333  3e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  43.06 
 
 
437 aa  330  3e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  42.43 
 
 
417 aa  330  3e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  43.06 
 
 
437 aa  330  3e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  42.35 
 
 
437 aa  323  4e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  42.28 
 
 
425 aa  319  7e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  42.22 
 
 
429 aa  316  6e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  40.48 
 
 
425 aa  315  8e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  41.9 
 
 
431 aa  312  4.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  41.81 
 
 
428 aa  312  6.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  43.64 
 
 
451 aa  310  4e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  43.36 
 
 
431 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  38.82 
 
 
428 aa  305  9.000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  40.86 
 
 
415 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  42.04 
 
 
422 aa  296  4e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  42.15 
 
 
428 aa  296  4e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  39.59 
 
 
577 aa  280  4e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  38.04 
 
 
429 aa  277  2e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1546  citrate transporter  38.79 
 
 
429 aa  273  4.0000000000000004e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0084311  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  40.14 
 
 
429 aa  268  2e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44788  predicted protein  38.3 
 
 
967 aa  264  3e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  38.19 
 
 
447 aa  258  1e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  39.9 
 
 
422 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  37.19 
 
 
408 aa  246  6e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1706  citrate transporter  32.12 
 
 
421 aa  205  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1699  citrate transporter  30.19 
 
 
421 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346911  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1763  citrate transporter  32.12 
 
 
421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3289  Citrate transporter  31.47 
 
 
444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2811  Citrate transporter  31.47 
 
 
444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0878  arsenical pump membrane protein  33.93 
 
 
445 aa  193  5e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.201371  hitchhiker  0.000139145 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4948  Citrate transporter  30.07 
 
 
445 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.837621 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0796  citrate transporter  28.81 
 
 
424 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5261  Citrate transporter  31.65 
 
 
447 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10417  normal  0.132031 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  27.68 
 
 
400 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1592  citrate transporter  27.9 
 
 
422 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0041  transport protein  30.05 
 
 
434 aa  162  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  28.61 
 
 
405 aa  155  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  29.7 
 
 
405 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0209  arsenical pump membrane protein, putative  28.74 
 
 
428 aa  152  8.999999999999999e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.144741  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  25.52 
 
 
465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  28.5 
 
 
419 aa  145  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  29.54 
 
 
414 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  29.47 
 
 
408 aa  143  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  27.3 
 
 
401 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  27.2 
 
 
396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5880  citrate transporter  27.17 
 
 
446 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0353  citrate transporter  26.56 
 
 
409 aa  137  5e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0143046  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  30.66 
 
 
404 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2052  citrate transporter  29.35 
 
 
447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  29.25 
 
 
404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0585  Citrate transporter  27.56 
 
 
396 aa  129  8.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176534 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1677  arsenical pump membrane protein  29.29 
 
 
413 aa  126  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  24.94 
 
 
411 aa  125  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2179  Citrate transporter  29.15 
 
 
429 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.365057  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  25.6 
 
 
402 aa  124  4e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  23.83 
 
 
436 aa  124  5e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0714  hypothetical protein  29.52 
 
 
410 aa  124  5e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.318283  normal  0.343566 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2268  Citrate transporter  29.4 
 
 
429 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153576  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0803  citrate transporter  25.31 
 
 
397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324785  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  25.9 
 
 
405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.771625 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  26.25 
 
 
414 aa  111  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1157  citrate transporter  25.93 
 
 
447 aa  108  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>